high mobility group AT-hook 1

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同義遺伝子名

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発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:59.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:36.90 脊柱:- 網膜:- 目:177.70 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:156 胸腺:245.80 骨髄:- 脂肪:- 骨:78.10 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE nodata
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:39.80 前立腺:113.90 卵巣:- 精巣:82.30 心臓:290.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:104.70 結腸:-     肝臓:79.80        肺:253.30    膀胱:- 腎臓:191.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:113.80 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE nodata
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_139327
Gene ID 117062
Unigene ID Rn.83614
Probe set ID -
Ensembl ID ENSRNOG00000000488

オーソログ対応遺伝子

ヒト[24]  NM_002131, NM_145899, NM_145901, NM_145902, NM_145903, NM_145905
マウス[29]  NM_001025427, NM_001039356, NM_001166535, NM_001166536, NM_001166537, NM_001166539, NM_001166540, NM_001166541, NM_001166542, NM_001166543, NM_001166544, NM_001166545, NM_001166546, NM_016660, NM_001166476

染色体

20p12  [5,769,052  -  5,772,284]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020478  A.T hook-like
IPR017956  AT hook, DNA-binding motif
IPR000116  High mobility group, HMG-I/HMG-Y
IPR000637  HMG-I/HMG-Y, DNA-binding, conserved site

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1702360
12082527
12653562
15192124
16641100

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006284  base-excision repair
GO:0008285  negative regulation of cell proliferation
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0009615  response to virus
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0051575  5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity
GO:0003677  DNA binding
GO:0003906  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase activity
GO:0019899  enzyme binding
GO:0030374  ligand-dependent nuclear receptor transcription coactivator activity
GO:0042975  peroxisome proliferator activated receptor binding
GO:0042974  retinoic acid receptor binding
GO:0046965  retinoid X receptor binding
GO:0003700  transcription factor activity
GO:0008134  transcription factor binding