mutY homolog (E. coli)

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同義遺伝子名

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発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:23.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:245.80 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE nodata
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:38 卵巣:- 精巣:- 心臓:38.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:26.60        肺:-    膀胱:- 腎臓:63.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE nodata
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_133316
Gene ID 170841
Unigene ID Rn.44045
Probe set ID -
Ensembl ID ENSRNOG00000017887

オーソログ対応遺伝子

ヒト[6]  NM_001048171, NM_001048172, NM_001048173, NM_001048174, NM_001128425, NM_012222
マウス[2]  NM_001159581, NM_133250, NM_001048173, NM_001048174, NM_001128425, NM_012222

染色体

5q36  [137,103,958  -  137,115,896]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR011257  DNA glycosylase
IPR004036  Endonuclease III, conserved site-2
IPR004035  Endonuclease III, iron-sulphur binding site
IPR003651  Endonuclease III-like, iron-sulphur cluster loop motif
IPR003583  Helix-hairpin-helix DNA-binding motif, class 1
IPR000445  Helix-hairpin-helix motif
IPR003265  HhH-GPD domain
IPR000086  NUDIX hydrolase domain
IPR015797  NUDIX hydrolase domain-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11818965
11948257
12472901
12477932
14690527
15273732

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006284  base-excision repair
GO:0006979  response to oxidative stress

Cellular Component

GO:0005739  mitochondrion
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0051539  4 iron, 4 sulfur cluster binding
GO:0019104  DNA N-glycosylase activity
GO:0004519  endonuclease activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0032405  MutLalpha complex binding
GO:0032406  MutLbeta complex binding
GO:0032407  MutSalpha complex binding
GO:0032408  MutSbeta complex binding