splicing factor proline/glutamine rich (polypyrimidine tract binding protein associated)

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同義遺伝子名

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発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:179.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:73.70 脊柱:- 網膜:- 目:35.50 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:312 胸腺:245.80 骨髄:- 脂肪:294.40 骨:234.30 皮膚:-
GeneChip 大脳:6.35 小脳:6.72 脳幹:6.46 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:6.24 脊柱:- 網膜:- 目:7 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:7.37 胸腺:8.30 骨髄:7.70 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:199.10 前立腺:151.80 卵巣:228.20 精巣:82.30 心臓:135.70 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:418.70 結腸:289.90     肝臓:13.30        肺:354.60    膀胱:- 腎臓:127.60 下垂体:236.90 甲状腺:- 副腎:6535.90 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:6.42 骨格筋:6.05 食道:- 胃:- 腸:7.29 結腸:7.28 肝臓:- 肺:- 膀胱:- 腎臓:6.35 下垂体:7.17 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001025271
Gene ID 252855
Unigene ID Rn.54645
Probe set ID AF036335_g_at  [RG_U34A]
Ensembl ID ENSRNOG00000013154

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_005066
マウス[4]  NM_023603

染色体

5q36  [146,460,934  -  146,469,278]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001464  Annexin
IPR013286  Annexin, type VII
IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9605521
12477932
15607978
19874820
21507896
22215678
22669741

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000380  alternative nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0016363  nuclear matrix
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0042382  paraspeckles

Molecular Function

GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding