endothelial differentiation-related factor 1

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同義遺伝子名

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発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:110.60 脊柱:- 網膜:- 目:177.70 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:245.80 骨髄:- 脂肪:294.40 骨:39 皮膚:-
GeneChip 大脳:8.44 小脳:8.92 脳幹:8.03 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.19 脊柱:- 網膜:- 目:8.24 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:8.53 胸腺:9.18 骨髄:8.46 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:39.80 前立腺:38 卵巣:228.20 精巣:- 心臓:58.20 骨格筋:531.50 食道:- 胃:1077.60 腸:- 結腸:289.90     肝臓:-        肺:101.30    膀胱:- 腎臓:63.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:56.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:8.66 骨格筋:8.94 食道:- 胃:- 腸:9.75 結腸:9.60 肝臓:- 肺:- 膀胱:- 腎臓:9.14 下垂体:8.19 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001106557
Gene ID 296570
Unigene ID Rn.17092
Probe set ID rc_AA891746_at  [RG_U34A]
Ensembl ID ENSRNOG00000016272

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_003792, NM_153200
マウス[2]  NM_021519, NM_153200

染色体

3p13  [3,727,811  -  3,732,116]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001387  Helix-turn-helix type 3
IPR010982  Lambda repressor-like, DNA-binding

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9795107
12477932
12729799
15489334
16854843

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030154  cell differentiation
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0043388  positive regulation of DNA binding
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0005669  transcription factor TFIID complex

Molecular Function

GO:0005516  calmodulin binding
GO:0004402  histone acetyltransferase activity
GO:0008168  methyltransferase activity
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003713  transcription coactivator activity
GO:0003700  transcription factor activity