serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

-

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:35.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:36.90 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:122.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:39 皮膚:-
GeneChip 大脳:7.80 小脳:7.62 脳幹:7.71 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.75 脊柱:- 網膜:- 目:8.06 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:7.71 胸腺:7.89 骨髄:7.75 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:119.50 前立腺:38 卵巣:342.30 精巣:- 心臓:38.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:104.70 結腸:-     肝臓:66.50        肺:50.70    膀胱:- 腎臓:127.60 下垂体:118.40 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:227.60 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:7.41 骨格筋:7.32 食道:- 胃:- 腸:7.79 結腸:7.75 肝臓:- 肺:- 膀胱:- 腎臓:7.51 下垂体:7.87 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001108406
Gene ID 361213
Unigene ID Rn.18996
Probe set ID rc_AA892380_at  [RG_U34A]
Ensembl ID ENSRNOG00000010882

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_006415, NM_178324
マウス[3]  NM_009269, NM_178324

染色体

17p14  [17,576,401  -  17,615,246]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR004839  Aminotransferase, class I/II
IPR015424  Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11816724
18922131

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0046513  ceramide biosynthetic process
GO:0046511  sphinganine biosynthetic process
GO:0006686  sphingomyelin biosynthetic process
GO:0046512  sphingosine biosynthetic process

Cellular Component

GO:0017059  serine C-palmitoyltransferase complex

Molecular Function

GO:0030170  pyridoxal phosphate binding
GO:0004758  serine C-palmitoyltransferase activity