lipopolysaccharide-induced TNF factor

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同義遺伝子名

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発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:47.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:73.70 脊柱:- 網膜:- 目:71.10 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:78 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:39 皮膚:470.80
GeneChip 大脳:7.29 小脳:7.22 脳幹:7.21 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:6.70 脊柱:- 網膜:- 目:7.93 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:7.63 胸腺:7.40 骨髄:7.89 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:1139 胎盤:557.50 前立腺:38 卵巣:- 精巣:- 心臓:193.90 骨格筋:265.70 食道:- 胃:- 腸:104.70 結腸:-     肝臓:133        肺:50.70    膀胱:- 腎臓:63.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:113.80 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:7.15 骨格筋:7.10 食道:- 胃:- 腸:8.03 結腸:8.09 肝臓:- 肺:- 膀胱:- 腎臓:7.76 下垂体:7.48 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
CAGE nodata
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001105735
Gene ID 65161
Unigene ID Rn.6940
Probe set ID rc_AI237535_s_at  [RG_U34A]
Ensembl ID ENSRNOG00000002520

オーソログ対応遺伝子

ヒト[6]  NM_001136472, NM_001136473, NM_004862
マウス[3]  NM_019980, NM_001136473, NM_004862

染色体

10q11  [4,587,487  -  4,623,903]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006629  LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9275072
12467897
12477932
21633715

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007568  aging
GO:0006915  apoptosis
GO:0071222  cellular response to lipopolysaccharide
GO:0042347  negative regulation of NF-kappaB import into nucleus
GO:0043123  positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade
GO:0001817  regulation of cytokine production
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0032496  response to lipopolysaccharide
GO:0007165  signal transduction
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005576  extracellular region
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0005765  lysosomal membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0004871  signal transducer activity
GO:0050699  WW domain binding