splicing factor 3a, subunit 3, 60kDa

同義遺伝子名

Splicing factor 3A subunit 3, Spliceosome-associated protein 61, SF3a60, PRP9, SAP61, SAP 61, PRPF9, splicing factor 3a, subunit 3, 60kDa, SF3A3

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:117.30

小脳:201.50

脳幹:-

脳梁:262.50

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:118.60

目:82.30

動脈:89.90

静脈:133.30

リンパ節:70.80

末梢血:91.10

脾臓:321.40

胸腺:231.90

骨髄:39.40

脂肪:121

骨:153.50

皮膚:134.40

GeneChip

大脳:6.15

小脳:6.11

脳幹:6.22

脳梁:6.12

松果体:-

末梢神経:6.36

脊柱:6.16

網膜:-

目:-

動脈:6.81

静脈:6.53

リンパ節:6.68

末梢血:-

脾臓:6.51

胸腺:6.58

骨髄:6.22

脂肪:6.42

骨:-

皮膚:6.89

CAGE

大脳:3.69

小脳:-

脳幹:3.84

脳梁:3.87

松果体:3.83

末梢神経:-

脊柱:3.67

網膜:-

目:-

動脈:3.49

静脈:3.86

リンパ節:3.94

末梢血:-

脾臓:4.03

胸腺:4.23

骨髄:-

脂肪:4.06

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.75

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.76

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.05

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:209.60

胎盤:120.20

前立腺:157.70

卵巣:186.30

精巣:134.10

心臓:127.70

骨格筋:80.40

食道:-

胃:63.70

腸:129.60

結腸:152.60

肝臓:31.70

肺:136.90

膀胱:251.20

腎臓:156

下垂体:579.90

甲状腺:-

副腎:355.50

膵臓:124.50

乳腺:102.20

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.78

胎盤:5.96

前立腺:6.63

卵巣:7.02

精巣:6.21

心臓:5.73

骨格筋:6.69

食道:6.59

胃:6.08

腸:6.19

結腸:6.21

肝臓:5.99

肺:6.32

膀胱:-

腎臓:6.28

下垂体:6.35

甲状腺:6.71

副腎:6.38

膵臓:5.21

乳腺:7

唾液腺:6.16

CAGE

子宮:4.04

胎盤:4.00

前立腺:3.98

卵巣:4.17

精巣:4.17

心臓:3.58

骨格筋:3.52

食道:3.89

胃:-

腸:3.66

結腸:3.70

肝臓:3.95

肺:3.49

膀胱:3.92

腎臓:3.86

下垂体:4.05

甲状腺:3.96

副腎:-

膵臓:3.89

乳腺:3.35

唾液腺:4.10

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.26

卵巣:5.02

精巣:4.78

心臓:2.65

骨格筋:2.97

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.21

肝臓:3.16

肺:3.36

膀胱:-

腎臓:4.15

下垂体:-

甲状腺:4.47

副腎:4.44

膵臓:-

乳腺:4.00

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_006802
Gene ID	10946
Unigene ID	Hs.77897
Probe set ID	203818_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000183431
GTEx ID	ENSG00000183431

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_029157
ラット[1]	NM_001025698

染色体

1p34.3 [38,422,647 - 38,456,593]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000690	Zinc finger, C2H2-type matrin
IPR003604	Zinc finger, U1-type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0006397	mRNA processing
GO:0000389	nuclear mRNA 3'-splice site recognition
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing
GO:0000375	RNA splicing, via transesterification reactions

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005681	spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0003676	nucleic acid binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008270	zinc ion binding

splicing factor 3a, subunit 3, 60kDa

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function