ligatin

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同義遺伝子名

HCA56, ligatin, Ligatin, Hepatocellular carcinoma-associated antigen 56, LGTN

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:29.60 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:- 目:47 動脈:239.80 静脈:66.60 リンパ節:20.20 末梢血:127.50 脾臓:56.70 胸腺:64.40 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:64 皮膚:19.20
GeneChip 大脳:6.85 小脳:6.40 脳幹:6.95 脳梁:7.24 松果体:- 末梢神経:7.25 脊柱:7.09 網膜:- 目:- 動脈:7.73 静脈:7.60 リンパ節:7.62 末梢血:- 脾臓:7.53 胸腺:7.63 骨髄:7.29 脂肪:7.89 骨:- 皮膚:7.83
CAGE 大脳:2.55 小脳:- 脳幹:2.77 脳梁:3.00 松果体:2.35 末梢神経:- 脊柱:2.56 網膜:- 目:- 動脈:3.04 静脈:3.03 リンパ節:3.09 末梢血:- 脾臓:2.61 胸腺:3.18 骨髄:- 脂肪:2.95 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.29 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.27 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.57 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:91.10 胎盤:65.60 前立腺:146.40 卵巣:37.30 精巣:47.60 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:342.80 胃:- 腸:- 結腸:59.40     肝臓:63.30        肺:73.30    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:101.60 膵臓:35.60 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.04 胎盤:7.49 前立腺:8.09 卵巣:8.30 精巣:7.69 心臓:7.41 骨格筋:8.13 食道:7.67 胃:7.50 腸:7.84 結腸:7.77 肝臓:7.33 肺:7.50 膀胱:- 腎臓:7.76 下垂体:7.35 甲状腺:7.91 副腎:7.64 膵臓:8.53 乳腺:8.01 唾液腺:8.31
CAGE 子宮:3.23 胎盤:2.65 前立腺:3.22 卵巣:3.25 精巣:2.82 心臓:2.57 骨格筋:2.89 食道:3.13 胃:- 腸:2.66 結腸:3.11     肝臓:2.87    肺:2.76 膀胱:2.89 腎臓:2.93 下垂体:2.57 甲状腺:3.32 副腎:- 膵臓:3.61 乳腺:3.24 唾液腺:3.44
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.72 卵巣:4.21 精巣:3.90 心臓:2.83 骨格筋:3.68 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.98     肝臓:3.25        肺:3.92    膀胱:- 腎臓:3.81 下垂体:- 甲状腺:4.19 副腎:3.92 膵臓:- 乳腺:4.03 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006893
Gene ID 1939
Unigene ID Hs.497581
Probe set ID 218253_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000143486
GTEx ID ENSG00000143486

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_001136070, NM_010709
ラット [0]  

染色体

1q32.1  [206,744,620  -  206,785,904]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002478  Pseudouridine synthase/archaeosine transglycosylase
IPR015947  Pseudouridine synthase/archaeosine transglycosylase-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2482295
7085778
7299841
8125298
12097419
12477932
14702039
15302935
17353931
20566627
21145461
22939629
23277564
24250222
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006886  intracellular protein transport

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm

Molecular Function

GO:0004872  receptor activity
GO:0003743  translation initiation factor activity