C-type lectin domain family 5, member A

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同義遺伝子名

CLECSF5, C-type lectin domain family 5 member A, Myeloid DAP12-associating lectin, C-type lectin superfamily member 5, MDL-1, C-type lectin domain family 5, member A, MDL1, MGC138304, CLEC5A

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:5.90 動脈:- 静脈:- リンパ節:30.30 末梢血:36.40 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:314.90 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:-
GeneChip 大脳:3.30 小脳:3.22 脳幹:3.32 脳梁:3.30 松果体:- 末梢神経:3.68 脊柱:3.36 網膜:- 目:- 動脈:3.40 静脈:3.76 リンパ節:3.13 末梢血:- 脾臓:3.01 胸腺:2.91 骨髄:6.71 脂肪:3.33 骨:- 皮膚:3.35
CAGE 大脳:0.76 小脳:- 脳幹:0.74 脳梁:0.70 松果体:1.58 末梢神経:- 脊柱:1.46 網膜:- 目:- 動脈:0.79 静脈:0.34 リンパ節:0.33 末梢血:- 脾臓:0.45 胸腺:0.50 骨髄:- 脂肪:0.46 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.54 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.14 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.49 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:2.96 胎盤:2.84 前立腺:2.99 卵巣:2.97 精巣:3.01 心臓:3.42 骨格筋:3.16 食道:3.21 胃:3.10 腸:3.39 結腸:3.24 肝臓:3.03 肺:4.50 膀胱:- 腎臓:3.22 下垂体:3.16 甲状腺:3.23 副腎:3.29 膵臓:3.17 乳腺:3.02 唾液腺:3.31
CAGE 子宮:0.51 胎盤:0.85 前立腺:0.33 卵巣:0.89 精巣:0.47 心臓:1.17 骨格筋:0.09 食道:0.46 胃:- 腸:0 結腸:0     肝臓:0.46    肺:2.10 膀胱:0.53 腎臓:0.88 下垂体:0.34 甲状腺:0.45 副腎:- 膵臓:0.94 乳腺:0 唾液腺:0.83
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.18 卵巣:1.01 精巣:0.41 心臓:0.14 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.07     肝臓:0.15        肺:0.66    膀胱:- 腎臓:0.60 下垂体:- 甲状腺:0.45 副腎:0.33 膵臓:- 乳腺:0.21 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_013252
Gene ID 23601
Unigene ID Hs.446235
Probe set ID 219890_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000258227
GTEx ID ENSG00000258227

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001038604, NM_021364
ラット[1]  NM_001109377, NM_021364

染色体

7q34  [141,627,157  -  141,646,807]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001304  C-type lectin
IPR016187  C-type lectin fold
IPR016186  C-type lectin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10449773
10508765
12477932
12690205
12853948
12945048
15489334
18496526
20057064
20237496
21094529
21566123
22536019
23152543
23568457

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006968  cellular defense response
GO:0045087  innate immune response
GO:0043066  negative regulation of apoptosis
GO:0002076  osteoblast development
GO:0050715  positive regulation of cytokine secretion
GO:0007165  signal transduction
GO:0019048  virus-host interaction

Cellular Component

GO:0009986  cell surface
GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0030246  carbohydrate binding
GO:0001618  viral receptor activity