HIV-1 Tat specific factor 1

同義遺伝子名

Tat-SF1, HTATSF1, dJ196E23.2, HIV Tat-specific factor 1, HIV-1 Tat specific factor 1, HIV TAT specific factor 1, TAT-SF1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:5.38

小脳:5.20

脳幹:5.42

脳梁:5.33

松果体:-

末梢神経:4.87

脊柱:5.35

網膜:-

目:-

動脈:4.77

静脈:5.21

リンパ節:4.82

末梢血:-

脾臓:4.73

胸腺:5.27

骨髄:4.86

脂肪:4.98

骨:-

皮膚:4.95

CAGE

大脳:3.78

小脳:-

脳幹:3.76

脳梁:3.84

松果体:4.02

末梢神経:-

脊柱:4.07

網膜:-

目:-

動脈:2.97

静脈:3.38

リンパ節:3.02

末梢血:-

脾臓:3.16

胸腺:3.35

骨髄:-

脂肪:3.50

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.09

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.55

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:5.11

胎盤:4.70

前立腺:5.05

卵巣:5.34

精巣:5.06

心臓:5.17

骨格筋:5.52

食道:4.89

胃:4.84

腸:5.01

結腸:4.64

肝臓:4.68

肺:4.82

膀胱:-

腎臓:4.86

下垂体:6.80

甲状腺:4.96

副腎:5.06

膵臓:4.75

乳腺:5

唾液腺:4.81

CAGE

子宮:3.64

胎盤:3.82

前立腺:3.63

卵巣:3.83

精巣:3.61

心臓:4.04

骨格筋:4.83

食道:3.26

胃:-

腸:2.92

結腸:3.14

肝臓:3.25

肺:3.26

膀胱:3.27

腎臓:3.52

下垂体:5.23

甲状腺:3.53

副腎:-

膵臓:2.94

乳腺:3.84

唾液腺:3.17

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.68

卵巣:0.24

精巣:0.04

心臓:0.64

骨格筋:1.73

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.00

肝臓:0.18

肺:0.31

膀胱:-

腎臓:0.29

下垂体:-

甲状腺:0.55

副腎:0.00

膵臓:-

乳腺:0.00

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001163280
Gene ID	27336
Unigene ID	-
Probe set ID	202601_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000102241
GTEx ID	ENSG00000102241

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_028242, NM_029371
ラット[1]	NM_001108259, NM_029371

染色体

Xq26.3 [135,579,238 - 135,594,505]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0032784	regulation of RNA elongation
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0019079	viral genome replication

Cellular Component

GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0000166	nucleotide binding
GO:0003723	RNA binding

HIV-1 Tat specific factor 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function