striatin, calmodulin binding protein 3

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同義遺伝子名

striatin, calmodulin binding protein 3, STRN3, GS2NA, Striatin-3, SG2NA, S/G2 antigen, Cell-cycle autoantigen SG2NA

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:17.80 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:148.30 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:118.60 目:11.80 動脈:30 静脈:- リンパ節:60.70 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:- 骨髄:39.40 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:57.60
GeneChip 大脳:4.66 小脳:4.55 脳幹:4.57 脳梁:4.66 松果体:- 末梢神経:4.77 脊柱:4.87 網膜:- 目:- 動脈:4.78 静脈:5.14 リンパ節:4.54 末梢血:- 脾臓:4.41 胸腺:4.36 骨髄:4.98 脂肪:4.75 骨:- 皮膚:4.60
CAGE 大脳:3.46 小脳:- 脳幹:3.54 脳梁:3.45 松果体:3.88 末梢神経:- 脊柱:3.49 網膜:- 目:- 動脈:3.69 静脈:3.44 リンパ節:2.98 末梢血:- 脾臓:3.48 胸腺:3.10 骨髄:- 脂肪:3.82 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.73 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.72 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.90 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:54.70 胎盤:21.90 前立腺:90.10 卵巣:74.50 精巣:17.30 心臓:- 骨格筋:20.10 食道:- 胃:42.50 腸:- 結腸:25.40     肝臓:63.30        肺:68.40    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:26.70 乳腺:102.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.66 胎盤:4.41 前立腺:4.80 卵巣:4.72 精巣:4.72 心臓:4.78 骨格筋:5.19 食道:4.67 胃:4.62 腸:4.80 結腸:4.58 肝臓:4.57 肺:4.66 膀胱:- 腎臓:4.56 下垂体:4.82 甲状腺:4.46 副腎:4.61 膵臓:5 乳腺:4.71 唾液腺:4.64
CAGE 子宮:3.77 胎盤:3.56 前立腺:3.85 卵巣:3.56 精巣:3.68 心臓:3.80 骨格筋:4.42 食道:3.79 胃:- 腸:3.40 結腸:3.47     肝臓:3.67    肺:3.50 膀胱:4.21 腎臓:3.39 下垂体:3.70 甲状腺:3.42 副腎:- 膵臓:2.76 乳腺:3.30 唾液腺:3.17
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.98 卵巣:1.76 精巣:2.05 心臓:1.05 骨格筋:1.25 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.92     肝臓:0.23        肺:1.27    膀胱:- 腎臓:0.67 下垂体:- 甲状腺:1.89 副腎:1.89 膵臓:- 乳腺:1.28 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001083893
Gene ID 29966
Unigene ID Hs.401843
Probe set ID 215505_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000196792
GTEx ID ENSG00000196792

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_001172098, NM_052973
ラット[1]  NM_001029897, NM_052973

染色体

14q12  [31,363,005  -  31,495,607]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472  G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7864889
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10681496
10748158
11251078
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12477932
15302935
16344560
16396496
16964243
17353931
17540176
18029348
18434427
18502210
18782753
19156129
19322201
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21890473
21906983
22863883
22939629
22990118
23000965
23277359
23455922
23678272
24250222
24255178
24550388
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0033147  negative regulation of estrogen receptor signaling pathway
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0032355  response to estradiol stimulus

Cellular Component

GO:0043025  cell soma
GO:0005737  cytoplasm
GO:0030425  dendrite
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0005886  plasma membrane
GO:0043234  protein complex
GO:0000159  protein phosphatase type 2A complex

Molecular Function

GO:0070016  armadillo repeat domain binding
GO:0005516  calmodulin binding
GO:0005515  protein binding
GO:0032403  protein complex binding
GO:0051721  protein phosphatase 2A binding
GO:0003700  transcription factor activity