CCR4-NOT transcription complex, subunit 4

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同義遺伝子名

Potential transcriptional repressor NOT4Hp, NOT4, NOT4H, CNOT4, CCR4-associated factor 4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, E3 ubiquitin protein ligase CNOT4, CCR4-NOT transcription complex, subunit 4, CLONE243

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:101.90 小脳:138.50 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:153.40 脊柱:- 網膜:237.30 目:41.10 動脈:60 静脈:66.60 リンパ節:80.90 末梢血:18.20 脾臓:37.80 胸腺:77.30 骨髄:39.40 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:105.60
GeneChip 大脳:5.86 小脳:5.73 脳幹:5.65 脳梁:5.81 松果体:- 末梢神経:6.12 脊柱:5.68 網膜:- 目:- 動脈:5.82 静脈:5.73 リンパ節:5.80 末梢血:- 脾臓:5.94 胸腺:5.88 骨髄:5.25 脂肪:5.48 骨:- 皮膚:5.70
CAGE 大脳:3.98 小脳:- 脳幹:4.06 脳梁:4.15 松果体:3.96 末梢神経:- 脊柱:3.93 網膜:- 目:- 動脈:3.59 静脈:3.51 リンパ節:3.65 末梢血:- 脾臓:3.64 胸腺:3.79 骨髄:- 脂肪:4.00 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.59 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.41 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.43 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:61.90 前立腺:33.80 卵巣:- 精巣:108.20 心臓:51.10 骨格筋:20.10 食道:- 胃:63.70 腸:32.40 結腸:50.90     肝臓:63.30        肺:53.80    膀胱:251.20 腎臓:41.60 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:35.60 乳腺:102.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.15 胎盤:5.77 前立腺:6.03 卵巣:6.18 精巣:6.84 心臓:5.81 骨格筋:6.01 食道:5.91 胃:5.63 腸:5.41 結腸:5.22 肝臓:5.71 肺:5.61 膀胱:- 腎臓:5.58 下垂体:5.77 甲状腺:6.24 副腎:5.61 膵臓:4.68 乳腺:5.70 唾液腺:5.73
CAGE 子宮:4.14 胎盤:3.70 前立腺:3.80 卵巣:3.92 精巣:4.03 心臓:3.58 骨格筋:3.72 食道:3.59 胃:- 腸:3.56 結腸:3.54     肝臓:2.89    肺:3.44 膀胱:3.84 腎臓:3.50 下垂体:4.13 甲状腺:3.83 副腎:- 膵臓:3.67 乳腺:3.54 唾液腺:3.83
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.76 卵巣:1.89 精巣:2.67 心臓:1.95 骨格筋:2.86 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.75     肝臓:0.09        肺:1.60    膀胱:- 腎臓:2.14 下垂体:- 甲状腺:1.67 副腎:0.32 膵臓:- 乳腺:1.62 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_013316
Gene ID 4850
Unigene ID Hs.490224
Probe set ID 203291_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000080802
GTEx ID ENSG00000080802

オーソログ対応遺伝子

マウス[30]  NM_001164411, NM_001164412, NM_001164413, NM_001164414, NM_016877
ラット[1]  NM_001037782, NM_001164412, NM_001164413, NM_001164414, NM_016877

染色体

7q33  [135,046,547  -  135,194,875]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1
IPR003954  RNA recognition, domain 1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10637334
11087754
11823428
12107410
12477932
14702039
15001359
15062086
15489334
16344560
18029348
19322201
19346402
19558367
19690564
20379614
21139048
21988832
22159038
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0000289  nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
GO:0051865  protein autoubiquitination
GO:0016070  RNA metabolic process

Cellular Component

GO:0030014  CCR4-NOT complex
GO:0005829  cytosol
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270  zinc ion binding