methyl-CpG binding domain protein 3

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同義遺伝子名

methyl-CpG binding domain protein 3, Methyl-CpG-binding protein MBD3, MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:42.70

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:141

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:131.40

末梢血:54.70

脾臓:37.80

胸腺:38.70

骨髄:-

脂肪:40.30

骨:25.60

皮膚:28.80

GeneChip

大脳:6.80

小脳:6.76

脳幹:6.76

脳梁:6.66

松果体:-

末梢神経:6.47

脊柱:6.53

網膜:-

目:-

動脈:6.90

静脈:6.83

リンパ節:6.78

末梢血:-

脾臓:6.60

胸腺:6.51

骨髄:6.67

脂肪:6.78

骨:-

皮膚:6.77

CAGE

大脳:2.55

小脳:-

脳幹:2.26

脳梁:2.44

松果体:1.91

末梢神経:-

脊柱:2.13

網膜:-

目:-

動脈:2.56

静脈:2.70

リンパ節:2.57

末梢血:-

脾臓:2.68

胸腺:2.86

骨髄:-

脂肪:2.50

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.85

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.04

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.63

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:45.60

胎盤:138.40

前立腺:123.90

卵巣:37.30

精巣:60.60

心臓:38.30

骨格筋:60.30

食道:-

胃:21.20

腸:97.20

結腸:42.40

肝臓:-

肺:39.10

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:327.50

副腎:50.80

膵臓:53.30

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.61

胎盤:7.18

前立腺:6.50

卵巣:6.60

精巣:6.90

心臓:6.66

骨格筋:6.93

食道:6.84

胃:6.68

腸:6.82

結腸:6.69

肝臓:6.97

肺:6.58

膀胱:-

腎臓:6.79

下垂体:7.06

甲状腺:6.76

副腎:6.88

膵臓:7.10

乳腺:6.59

唾液腺:6.64

CAGE

子宮:2.46

胎盤:3.13

前立腺:2.60

卵巣:2.82

精巣:2.92

心臓:2.79

骨格筋:2.71

食道:2.61

胃:-

腸:2.54

結腸:2.77

肝臓:2.59

肺:2.48

膀胱:2.19

腎臓:2.56

下垂体:2.23

甲状腺:2.70

副腎:-

膵臓:2.90

乳腺:2.87

唾液腺:2.60

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.25

卵巣:4.38

精巣:4.00

心臓:3.03

骨格筋:2.94

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.48

肝臓:3.44

肺:3.01

膀胱:-

腎臓:3.41

下垂体:-

甲状腺:3.97

副腎:4.28

膵臓:-

乳腺:3.97

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003926
Gene ID	53615
Unigene ID	Hs.178728
Probe set ID	202463_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000071655
GTEx ID	ENSG00000071655

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_013595
ラット[1]	NM_013595

染色体

19p13.3 [1,576,678 - 1,592,710]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR016177	DNA-binding, integrase-type
IPR001739	Methyl-CpG DNA binding

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016573	histone acetylation
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0006346	methylation-dependent chromatin silencing
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0009888	tissue development
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0000792	heterochromatin
GO:0016581	NuRD complex

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding

methyl-CpG binding domain protein 3

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function