POU class 6 homeobox 1

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同義遺伝子名

Brain-5, POU domain, class 6, transcription factor 1, BRN5, POU6F1, MPOU, Brain-specific homeobox/POU domain protein 5, Brn-5 protein, mPOU homeobox protein, TCFB1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:8.30 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:23.50 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:6.35 小脳:6.53 脳幹:6.24 脳梁:6.11 松果体:- 末梢神経:5.54 脊柱:5.66 網膜:- 目:- 動脈:5.84 静脈:5.94 リンパ節:6.20 末梢血:- 脾臓:5.72 胸腺:5 骨髄:5.57 脂肪:5.78 骨:- 皮膚:5.57
CAGE 大脳:2.71 小脳:- 脳幹:2.66 脳梁:2.47 松果体:1.94 末梢神経:- 脊柱:2.41 網膜:- 目:- 動脈:2.10 静脈:1.92 リンパ節:1.43 末梢血:- 脾臓:1.58 胸腺:0.33 骨髄:- 脂肪:1.86 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.02 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.84 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.61 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.86 胎盤:5.44 前立腺:5.66 卵巣:5.87 精巣:5 心臓:6.04 骨格筋:6.24 食道:5.54 胃:5.73 腸:5.56 結腸:5.98 肝臓:5.74 肺:6.04 膀胱:- 腎臓:5.88 下垂体:5.78 甲状腺:5.80 副腎:6 膵臓:5.78 乳腺:5.79 唾液腺:5.76
CAGE 子宮:2.16 胎盤:0.68 前立腺:2.14 卵巣:2.53 精巣:1.38 心臓:1.48 骨格筋:1.59 食道:1.78 胃:- 腸:0.96 結腸:1.29     肝臓:0.90    肺:1.46 膀胱:1.76 腎臓:1.48 下垂体:1.51 甲状腺:2.12 副腎:- 膵臓:0 乳腺:1.53 唾液腺:0.83
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.16 卵巣:1.67 精巣:0.91 心臓:0.36 骨格筋:2.08 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.11     肝臓:0.11        肺:1.53    膀胱:- 腎臓:0.74 下垂体:- 甲状腺:0.49 副腎:1.52 膵臓:- 乳腺:0.37 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_002702
Gene ID 5463
Unigene ID Hs.555886
Probe set ID 205878_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000184271
GTEx ID ENSG00000184271

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_010127
ラット[1]  NM_001105746

染色体

12q13.13  [51,580,719  -  51,611,477]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1408763
7908264
8102789
8567814
8889548
12477932
14702039
15489334
16344560
18029348
18323601
18976975
19450691
19874398
20134265

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007420  brain development
GO:0007507  heart development
GO:0007517  muscle organ development
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0043231  intracellular membrane-bounded organelle
GO:0031965  nuclear membrane

Molecular Function

GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity