splicing factor 4

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同義遺伝子名

DKFZp434E2216, SF4, Splicing factor 4, F23858, splicing factor 4, RNA-binding protein RBP

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:32

小脳:50.40

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:35.30

動脈:-

静脈:-

リンパ節:30.30

末梢血:18.20

脾臓:56.70

胸腺:38.70

骨髄:-

脂肪:80.70

骨:64

皮膚:38.40

GeneChip

大脳:7.35

小脳:7.58

脳幹:7.31

脳梁:7.49

松果体:-

末梢神経:7.47

脊柱:7.30

網膜:-

目:-

動脈:7.64

静脈:7.36

リンパ節:7.76

末梢血:-

脾臓:7.74

胸腺:7.89

骨髄:7.41

脂肪:7.41

骨:-

皮膚:7.47

CAGE

大脳:2.50

小脳:-

脳幹:2.43

脳梁:2.51

松果体:2.47

末梢神経:-

脊柱:2.76

網膜:-

目:-

動脈:2.32

静脈:1.95

リンパ節:2.28

末梢血:-

脾臓:1.92

胸腺:2.38

骨髄:-

脂肪:1.63

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.81

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.94

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.67

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:43.70

前立腺:22.50

卵巣:37.30

精巣:112.50

心臓:38.30

骨格筋:20.10

食道:-

胃:106.20

腸:64.80

結腸:42.40

肝臓:42.20

肺:39.10

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:232

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.35

胎盤:7.15

前立腺:7.32

卵巣:7.41

精巣:7.63

心臓:6.94

骨格筋:7.10

食道:7.45

胃:7.32

腸:7.29

結腸:7.24

肝臓:7.37

肺:7.48

膀胱:-

腎臓:7.27

下垂体:7.80

甲状腺:7.69

副腎:7.61

膵臓:7.37

乳腺:7.51

唾液腺:7.28

CAGE

子宮:2.01

胎盤:2.07

前立腺:2.00

卵巣:2.12

精巣:2.82

心臓:2.13

骨格筋:2.36

食道:2.05

胃:-

腸:2.27

結腸:2.07

肝臓:1.97

肺:2.09

膀胱:1.88

腎臓:2.06

下垂体:2.21

甲状腺:2.08

副腎:-

膵臓:2.34

乳腺:2.02

唾液腺:2.26

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.19

卵巣:3.03

精巣:4.07

心臓:2.42

骨格筋:3.12

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.70

肝臓:2.14

肺:1.77

膀胱:-

腎臓:2.81

下垂体:-

甲状腺:3.20

副腎:3.22

膵臓:-

乳腺:2.82

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_172231
Gene ID	57794
Unigene ID	Hs.515274
Probe set ID	209547_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000105705
GTEx ID	ENSG00000105705

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_027481
ラット[1]	NM_001011920

染色体

19p13.11 [19,387,323 - 19,431,318]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed (Pubmed ID)

12176931
12226669
12477932
12594045
14702039
15057824
15489334
17332742
18029348
19060906
19656773
20686565
20864672
21139048
21988832
22365833
22412018
22939629
23974872
24097068
24457600

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing

Cellular Component

GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005681	spliceosomal complex

Molecular Function