regulatory factor X, 1 (influences HLA class II expression)

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同義遺伝子名

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, Enhancer factor C, EF-C, RFX

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:3.82

小脳:3.95

脳幹:3.88

脳梁:3.79

松果体:-

末梢神経:3.71

脊柱:3.74

網膜:-

目:-

動脈:3.84

静脈:3.75

リンパ節:3.94

末梢血:-

脾臓:3.73

胸腺:3.84

骨髄:3.94

脂肪:3.88

骨:-

皮膚:4.03

CAGE

大脳:2.60

小脳:-

脳幹:2.51

脳梁:2.57

松果体:2.75

末梢神経:-

脊柱:2.56

網膜:-

目:-

動脈:2.17

静脈:2.92

リンパ節:2.42

末梢血:-

脾臓:2.70

胸腺:2.93

骨髄:-

脂肪:2.41

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.52

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.03

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.46

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:3.87

胎盤:3.65

前立腺:3.81

卵巣:3.92

精巣:4.14

心臓:3.72

骨格筋:3.95

食道:3.85

胃:3.54

腸:3.83

結腸:3.75

肝臓:3.71

肺:3.95

膀胱:-

腎臓:3.83

下垂体:4.09

甲状腺:3.83

副腎:3.72

膵臓:4.22

乳腺:3.75

唾液腺:3.65

CAGE

子宮:2.79

胎盤:2.70

前立腺:2.64

卵巣:2.71

精巣:3.12

心臓:2.15

骨格筋:2.16

食道:2.29

胃:-

腸:2.31

結腸:2.42

肝臓:2.31

肺:2.51

膀胱:2.13

腎臓:2.45

下垂体:3.34

甲状腺:2.96

副腎:-

膵臓:2.71

乳腺:2.11

唾液腺:2.43

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.80

卵巣:2.13

精巣:2.93

心臓:1.17

骨格筋:2.11

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.21

肝臓:0.72

肺:1.61

膀胱:-

腎臓:1.46

下垂体:-

甲状腺:1.84

副腎:1.47

膵臓:-

乳腺:1.53

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002918
Gene ID	5989
Unigene ID	-
Probe set ID	206321_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000132005
GTEx ID	ENSG00000132005

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009055
ラット[1]	NM_001105944

染色体

19p13.12 [14,072,343 - 14,117,134]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006955

immune response

Cellular Component

GO:0005634

nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003705	RNA polymerase II transcription factor activity, enhancer binding

regulatory factor X, 1 (influences HLA class II expression)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function