regulatory factor X, 5 (influences HLA class II expression)

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同義遺伝子名

DNA-binding protein RFX5, Regulatory factor X subunit 5, RFX5

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:113.80 小脳:163.70 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:58.80 動脈:30 静脈:- リンパ節:70.80 末梢血:109.30 脾臓:75.60 胸腺:180.40 骨髄:39.40 脂肪:- 骨:38.40 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:6.48 小脳:6.61 脳幹:6.59 脳梁:6.50 松果体:- 末梢神経:6.54 脊柱:6.62 網膜:- 目:- 動脈:6.51 静脈:6.46 リンパ節:6.86 末梢血:- 脾臓:6.89 胸腺:7.22 骨髄:6.75 脂肪:6.49 骨:- 皮膚:6.02
CAGE 大脳:2.16 小脳:- 脳幹:2.63 脳梁:2.47 松果体:2.52 末梢神経:- 脊柱:2.52 網膜:- 目:- 動脈:2.65 静脈:3.29 リンパ節:2.98 末梢血:- 脾臓:3.04 胸腺:3.16 骨髄:- 脂肪:2.20 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.41 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.36 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.46 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:145.80 胎盤:29.10 前立腺:78.90 卵巣:- 精巣:125.50 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:342.80 胃:63.70 腸:32.40 結腸:50.90     肝臓:-        肺:97.80    膀胱:125.60 腎臓:52 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:71.10 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.57 胎盤:6.22 前立腺:6.38 卵巣:6.27 精巣:6.80 心臓:6.46 骨格筋:6.47 食道:6.25 胃:6.65 腸:6.49 結腸:6.73 肝臓:6.42 肺:6.35 膀胱:- 腎臓:6.54 下垂体:6.78 甲状腺:6.44 副腎:6.42 膵臓:6.04 乳腺:6.28 唾液腺:6.15
CAGE 子宮:2.45 胎盤:1.66 前立腺:2.49 卵巣:2.00 精巣:2.24 心臓:2.32 骨格筋:1.94 食道:2.39 胃:- 腸:2.87 結腸:2.59     肝臓:1.86    肺:2.36 膀胱:2.32 腎臓:2.54 下垂体:2.34 甲状腺:2.51 副腎:- 膵臓:1.98 乳腺:1.68 唾液腺:2.60
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.63 卵巣:2.83 精巣:3.20 心臓:2.51 骨格筋:2.22 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.34     肝臓:0.87        肺:2.78    膀胱:- 腎臓:2.88 下垂体:- 甲状腺:2.82 副腎:3.49 膵臓:- 乳腺:2.45 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001025603
Gene ID 5993
Unigene ID Hs.632472
Probe set ID 202964_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000143390
GTEx ID ENSG00000143390

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_017395
ラット[1]  NM_001107694

染色体

1q21.3  [151,313,116  -  151,319,833]
LRG_101  [5,001  -  11,654]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7744245
8125298
9118943
9177217
9190936
9401005
9806546
10072068
10079298
10779326
10825209
11003667
11244040
11986307
12368908
12477932
12697811
12968017
15210800
15253423
15489334
15964851
16464847
16710414
17611194
18723135
18842294
19041327
20431927
20732328
22649097
22939629
23079621
23911394
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003700  transcription factor activity