vacuolar protein sorting 16 homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

vacuolar protein sorting 16 (yeast homolog), vacuolar protein sorting 16 (yeast), hVPS16, VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:3.89 小脳:4.15 脳幹:4.03 脳梁:3.82 松果体:- 末梢神経:3.75 脊柱:3.74 網膜:- 目:- 動脈:3.89 静脈:3.91 リンパ節:3.80 末梢血:- 脾臓:3.70 胸腺:3.49 骨髄:3.79 脂肪:3.72 骨:- 皮膚:3.93
CAGE 大脳:2.88 小脳:- 脳幹:3.02 脳梁:2.95 松果体:2.26 末梢神経:- 脊柱:2.66 網膜:- 目:- 動脈:2.55 静脈:2.92 リンパ節:2.63 末梢血:- 脾臓:2.64 胸腺:2.82 骨髄:- 脂肪:2.88 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.05 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.11 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:3.69 胎盤:3.65 前立腺:3.53 卵巣:3.66 精巣:3.61 心臓:3.98 骨格筋:4.04 食道:3.57 胃:3.72 腸:3.72 結腸:4.03 肝臓:3.90 肺:3.68 膀胱:- 腎臓:3.67 下垂体:3.65 甲状腺:3.50 副腎:3.88 膵臓:4.16 乳腺:3.60 唾液腺:3.79
CAGE 子宮:2.83 胎盤:2.58 前立腺:2.42 卵巣:2.49 精巣:2.64 心臓:2.48 骨格筋:2.43 食道:2.56 胃:- 腸:2.84 結腸:2.80     肝臓:2.62    肺:2.51 膀胱:2.39 腎臓:2.50 下垂体:2.74 甲状腺:2.79 副腎:- 膵臓:2.48 乳腺:2.47 唾液腺:2.97
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.22 卵巣:0.21 精巣:0.40 心臓:0.85 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.06     肝臓:1.38        肺:0.49    膀胱:- 腎臓:1.33 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.78 膵臓:- 乳腺:0.61 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_080413
Gene ID 64601
Unigene ID -
Probe set ID 215216_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000215305
GTEx ID ENSG00000215305

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_030559
ラット[1]  NM_001005541

染色体

20p13  [2,821,349  -  2,847,378]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11250079
11382755
11780052
12477932
14702039
15489334
16203730
17897319
18552835
18799622
19109425
20434987
21139048
21890473
21906983
21963094
21987572
22505724
22939629
23000965
23901104
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006886  intracellular protein transport

Cellular Component

GO:0005884  actin filament
GO:0030424  axon
GO:0043025  cell soma
GO:0005769  early endosome
GO:0030897  HOPS complex
GO:0005770  late endosome
GO:0031902  late endosome membrane
GO:0005765  lysosomal membrane
GO:0055037  recycling endosome

Molecular Function

GO:0051015  actin filament binding