SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 1

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同義遺伝子名

BAF155, SMARCC1, Rsc8, BRG1-associated factor 155, SWI/SNF complex 155 kDa subunit, SRG3, CRACC1, SWI3

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:46.20

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:112.30

網膜:118.60

目:64.60

動脈:60

静脈:-

リンパ節:111.20

末梢血:36.40

脾臓:18.90

胸腺:51.50

骨髄:98.40

脂肪:121

骨:64

皮膚:120

GeneChip

大脳:5.43

小脳:4.92

脳幹:5.37

脳梁:5.82

松果体:-

末梢神経:5.42

脊柱:5.69

網膜:-

目:-

動脈:5.24

静脈:5.01

リンパ節:5.68

末梢血:-

脾臓:5.87

胸腺:6.57

骨髄:5.86

脂肪:5.45

骨:-

皮膚:5.40

CAGE

大脳:2.91

小脳:-

脳幹:3.29

脳梁:3.58

松果体:2.76

末梢神経:-

脊柱:3.19

網膜:-

目:-

動脈:3.42

静脈:3.56

リンパ節:3.57

末梢血:-

脾臓:3.47

胸腺:4.21

骨髄:-

脂肪:3.40

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.41

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.56

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.82

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:154.90

胎盤:91.10

前立腺:112.60

卵巣:74.50

精巣:121.10

心臓:102.20

骨格筋:80.40

食道:-

胃:233.70

腸:97.20

結腸:229

肝臓:63.30

肺:73.30

膀胱:-

腎臓:62.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:26.70

乳腺:204.40

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.03

胎盤:5.68

前立腺:6.15

卵巣:6.06

精巣:6.48

心臓:5.27

骨格筋:5.06

食道:6.27

胃:5.96

腸:5.68

結腸:5.98

肝臓:5.48

肺:5.29

膀胱:-

腎臓:5.83

下垂体:5.30

甲状腺:5.72

副腎:5.01

膵臓:5.78

乳腺:5.99

唾液腺:5.86

CAGE

子宮:3.61

胎盤:3.84

前立腺:3.75

卵巣:3.36

精巣:3.57

心臓:2.86

骨格筋:3.00

食道:3.57

胃:-

腸:3.46

結腸:3.61

肝臓:3.19

肺:3.27

膀胱:3.70

腎臓:3.23

下垂体:3.16

甲状腺:3.57

副腎:-

膵臓:3.65

乳腺:3.16

唾液腺:3.53

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.69

卵巣:4.34

精巣:4.61

心臓:2.72

骨格筋:3.96

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.59

肝臓:2.51

肺:3.73

膀胱:-

腎臓:3.79

下垂体:-

甲状腺:4.35

副腎:3.77

膵臓:-

乳腺:3.76

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003074
Gene ID	6599
Unigene ID	Hs.476179
Probe set ID	201073_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000173473
GTEx ID	ENSG00000173473

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_009211
ラット[1]	NM_001106861

染色体

3p21.31 [47,626,762 - 47,823,596]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953	Chromo domain
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related
IPR017877	MYB-like
IPR001005	SANT, DNA-binding

GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0008286	insulin receptor signaling pathway
GO:0007399	nervous system development
GO:0006337	nucleosome disassembly
GO:0009887	organ morphogenesis
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0016514	SWI/SNF complex
GO:0001741	XY body

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0047485	protein N-terminus binding
GO:0003713	transcription coactivator activity

SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function