synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 1 (C. elegans)

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同義遺伝子名

7h3, SYDE1, FLJ13511

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:5.26 小脳:5.08 脳幹:5.32 脳梁:5.09 松果体:- 末梢神経:5.19 脊柱:5.18 網膜:- 目:- 動脈:5.46 静脈:5.32 リンパ節:5.06 末梢血:- 脾臓:4.88 胸腺:5 骨髄:5.16 脂肪:5.38 骨:- 皮膚:5.57
CAGE 大脳:1.10 小脳:- 脳幹:1.31 脳梁:1.70 松果体:1.25 末梢神経:- 脊柱:1.38 網膜:- 目:- 動脈:3.07 静脈:2.13 リンパ節:1.54 末梢血:- 脾臓:2.17 胸腺:0.54 骨髄:- 脂肪:2.87 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.86 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.84 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.07 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:5.14 胎盤:5.72 前立腺:5.17 卵巣:4.92 精巣:5.18 心臓:5.52 骨格筋:5.55 食道:5.09 胃:5.02 腸:5.04 結腸:5.23 肝臓:5.16 肺:4.99 膀胱:- 腎臓:5.25 下垂体:5.52 甲状腺:5.10 副腎:5.29 膵臓:5.41 乳腺:4.97 唾液腺:5.08
CAGE 子宮:2.77 胎盤:4.12 前立腺:2.67 卵巣:3.02 精巣:1.95 心臓:2.46 骨格筋:1.51 食道:2.55 胃:- 腸:1.71 結腸:1.99     肝臓:1.37    肺:2.10 膀胱:2.70 腎臓:2.15 下垂体:0.32 甲状腺:2.19 副腎:- 膵臓:1.74 乳腺:3.22 唾液腺:0.83
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.17 卵巣:3.67 精巣:2.96 心臓:1.81 骨格筋:0.93 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.82     肝臓:0.88        肺:2.47    膀胱:- 腎臓:2.51 下垂体:- 甲状腺:2.16 副腎:3.17 膵臓:- 乳腺:2.70 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_033025
Gene ID 85360
Unigene ID -
Probe set ID 216271_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000105137
GTEx ID ENSG00000105137

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_027875
ラット [0]  

染色体

19p13.12  [15,218,214  -  15,225,789]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008936  Rho GTPase activation protein
IPR000198  RhoGAP

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932
14702039
19531213
21139048

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0032862  activation of Rho GTPase activity
GO:0051056  regulation of small GTPase mediated signal transduction
GO:0007264  small GTPase mediated signal transduction

Cellular Component

GO:0005829  cytosol

Molecular Function

GO:0005100  Rho GTPase activator activity