DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 23

同義遺伝子名

U5-100kD, prp28, DDX23, DEAD box protein 23, PRPF28, MGC8416, U5-100K, 100 kDa U5 snRNP-specific protein, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 23, PRP28 homolog

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:177.80

小脳:403

脳幹:-

脳梁:291.60

松果体:-

末梢神経:184

脊柱:-

網膜:-

目:88.20

動脈:119.90

静脈:199.90

リンパ節:91

末梢血:182.20

脾臓:151.30

胸腺:785.90

骨髄:19.70

脂肪:40.30

骨:345.50

皮膚:81.60

GeneChip

大脳:6.19

小脳:6.23

脳幹:6.20

脳梁:6.28

松果体:-

末梢神経:6.26

脊柱:6.41

網膜:-

目:-

動脈:6.79

静脈:6.32

リンパ節:7

末梢血:-

脾臓:7.16

胸腺:7.40

骨髄:6.78

脂肪:6.55

骨:-

皮膚:6.73

CAGE

大脳:3.73

小脳:-

脳幹:3.60

脳梁:3.58

松果体:3.72

末梢神経:-

脊柱:3.83

網膜:-

目:-

動脈:3.67

静脈:3.88

リンパ節:3.44

末梢血:-

脾臓:3.81

胸腺:4.07

骨髄:-

脂肪:3.57

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.90

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.17

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.65

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:136.70

胎盤:178.50

前立腺:67.60

卵巣:74.50

精巣:242.30

心臓:102.20

骨格筋:20.10

食道:-

胃:63.70

腸:64.80

結腸:93.30

肝臓:116.10

肺:254.20

膀胱:376.80

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:80

乳腺:92.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.78

胎盤:6.79

前立腺:6.94

卵巣:6.95

精巣:6.72

心臓:6.22

骨格筋:6.92

食道:6.81

胃:6.68

腸:6.51

結腸:6.83

肝臓:6.44

肺:6.82

膀胱:-

腎臓:6.50

下垂体:6.37

甲状腺:6.76

副腎:6.50

膵臓:6.14

乳腺:6.93

唾液腺:6.57

CAGE

子宮:3.67

胎盤:3.87

前立腺:3.70

卵巣:3.62

精巣:3.59

心臓:3.66

骨格筋:4.08

食道:3.52

胃:-

腸:3.73

結腸:3.66

肝臓:3.85

肺:3.56

膀胱:3.54

腎臓:3.60

下垂体:3.54

甲状腺:3.61

副腎:-

膵臓:3.65

乳腺:3.45

唾液腺:3.45

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.69

卵巣:4.74

精巣:4.71

心臓:3.18

骨格筋:4.14

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.51

肝臓:3.63

肺:4.58

膀胱:-

腎臓:4.20

下垂体:-

甲状腺:5.02

副腎:4.77

膵臓:-

乳腺:4.00

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_004818
Gene ID	9416
Unigene ID	Hs.130098
Probe set ID	40465_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000174243
GTEx ID	ENSG00000174243

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_001080981
ラット[1]	NM_001106793

染色体

12q13.12 [49,223,840 - 49,246,625]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

GO:0000354	cis assembly of pre-catalytic spliceosome
GO:0010467	gene expression
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing
GO:0000375	RNA splicing, via transesterification reactions

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005739	mitochondrion
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005886	plasma membrane
GO:0005682	U5 snRNP

GO:0005524	ATP binding
GO:0008026	ATP-dependent helicase activity
GO:0004004	ATP-dependent RNA helicase activity
GO:0003676	nucleic acid binding
GO:0005515	protein binding

DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 23

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function