RNA binding motif protein 8A

同義遺伝子名

RNA binding motif protein 8A, RBM8, RNA-binding protein Y14, HSPC114, RBM8B, Ribonucleoprotein RBM8A, ZRNP1, Y14, BOV-1, ZNRP, BOV-1B, MDS014, RNA-binding motif protein 8A, BOV-1A, Binder of OVCA1-1, RBM8A, BOV-1C, RNA-binding protein 8A

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:4.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:12.90

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:5.78

小脳:5.76

脳幹:5.70

脳梁:6.09

松果体:-

末梢神経:5.63

脊柱:5.99

網膜:-

目:-

動脈:5.30

静脈:5.40

リンパ節:5.54

末梢血:-

脾臓:5.96

胸腺:6.31

骨髄:5.80

脂肪:5.28

骨:-

皮膚:5.69

CAGE

大脳:2.16

小脳:-

脳幹:2.05

脳梁:2.29

松果体:2.11

末梢神経:-

脊柱:2.77

網膜:-

目:-

動脈:1.75

静脈:1.39

リンパ節:1.38

末梢血:-

脾臓:1.56

胸腺:1.75

骨髄:-

脂肪:1.76

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.01

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.79

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.01

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:36.50

胎盤:3.60

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:4.90

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.71

胎盤:5.23

前立腺:6.03

卵巣:5.77

精巣:5.42

心臓:5.40

骨格筋:5.73

食道:6.06

胃:5.42

腸:5.55

結腸:5.60

肝臓:5.45

肺:5.57

膀胱:-

腎臓:5.84

下垂体:5.50

甲状腺:5.85

副腎:5.48

膵臓:5.01

乳腺:5.76

唾液腺:5.39

CAGE

子宮:2.17

胎盤:1.51

前立腺:1.74

卵巣:2.08

精巣:2.25

心臓:2.09

骨格筋:2.81

食道:1.60

胃:-

腸:1.76

結腸:1.24

肝臓:1.76

肺:1.89

膀胱:1.91

腎臓:1.84

下垂体:1.76

甲状腺:1.81

副腎:-

膵臓:1.42

乳腺:1.36

唾液腺:2.01

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.85

卵巣:4.53

精巣:3.87

心臓:2.82

骨格筋:4.90

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.61

肝臓:3.20

肺:3.38

膀胱:-

腎臓:4.11

下垂体:-

甲状腺:4.30

副腎:4.01

膵臓:-

乳腺:3.67

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005105
Gene ID	9939
Unigene ID	Hs.356873
Probe set ID	217857_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000131795
GTEx ID	ENSG00000131795

オーソログ対応遺伝子

マウス[9]	NM_001102407, NM_025875, NM_001039518
ラット[9]	NM_001102407, NM_025875, NM_001039518

染色体

1q21.1 [145,507,598 - 145,511,444]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0031124	mRNA 3'-end processing
GO:0006406	mRNA export from nucleus
GO:0016071	mRNA metabolic process
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000184	nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0006417	regulation of translation
GO:0016070	RNA metabolic process
GO:0008380	RNA splicing
GO:0006369	termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0035145	exon-exon junction complex
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003729	mRNA binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

RNA binding motif protein 8A

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function