ubiquitin specific peptidase 52

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同義遺伝子名

AW742773, AI047843, ubiquitin specific peptidase 52, 1200014O24Rik, Usp52, mKIAA0710

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:105.90 小脳:73.70 脳幹:158.90 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:114.70 脊柱:47.30 網膜:- 目:205.20 動脈:168.80 静脈:- リンパ節:237.60 末梢血:186.90 脾臓:131.70 胸腺:98.80 骨髄:38.50 脂肪:- 骨:87.70 皮膚:23.80
GeneChip 大脳:6.97 小脳:8.33 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.08 脊柱:6.65 網膜:8.13 目:7.45 動脈:- 静脈:7.81 リンパ節:8.48 末梢血:- 脾臓:8.73 胸腺:- 骨髄:8.57 脂肪:7.53 骨:8.53 皮膚:8.33
CAGE 大脳:2.75 小脳:- 脳幹:2.45 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.53 網膜:- 目:- 動脈:2.83 静脈:- リンパ節:3.71 末梢血:- 脾臓:2.73 胸腺:3.07 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.84 皮膚:3.15
RNA-seq 大脳:2.09 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:218.10 胎盤:- 前立腺:30.90 卵巣:149.40 精巣:44.30 心臓:37.20 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:35.20     肝臓:27.20        肺:120.50    膀胱:66.20 腎臓:64.50 下垂体:232.50 甲状腺:224.90 副腎:- 膵臓:84.40 乳腺:49 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.16 胎盤:8.26 前立腺:8.40 卵巣:8.19 精巣:7.86 心臓:6.70 骨格筋:6.84 食道:- 胃:7.55 腸:8.21 結腸:- 肝臓:7.93 肺:7.79 膀胱:7.48 腎臓:7.03 下垂体:7.56 甲状腺:- 副腎:8.46 膵臓:7.69 乳腺:7.76 唾液腺:8.58
CAGE 子宮:2.85 胎盤:3.09 前立腺:2.93 卵巣:3.11 精巣:3.21 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.60 腸:2.87 結腸:2.76     肝臓:2.38    肺:2.89 膀胱:2.78 腎臓:- 下垂体:3.02 甲状腺:- 副腎:2.70 膵臓:2.83 乳腺:2.62 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.09 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.47        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_133992
Gene ID 103135
Unigene ID Mm.244183
Probe set ID 1426700_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000005682

オーソログ対応遺伝子

ヒト[6]  NM_001127460, NM_001166279, NM_014871
ラット[1]  NM_001008862, NM_001166279, NM_014871

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006055  Exonuclease
IPR013520  Exonuclease, RNase T/DNA polymerase III
IPR012337  Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H fold

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10922068
11042159
11076861
11125038
11217851
11544199
12466851
12477932
12520002
14610273
14621295
15489334
15782199
16141072
16141073
18625844
18799693
21677750

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000291  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic
GO:0000184  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0000289  nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
GO:0006511  ubiquitin-dependent protein catabolic process

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0000932  cytoplasmic mRNA processing body
GO:0005634  nucleus
GO:0031251  PAN complex

Molecular Function

GO:0000175  3'-5'-exoribonuclease activity
GO:0004527  exonuclease activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0004518  nuclease activity
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0004535  poly(A)-specific ribonuclease activity
GO:0005515  protein binding
GO:0004221  ubiquitin thiolesterase activity