collagen, type XVI, alpha 1

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同義遺伝子名

[a]1 (XVI) collagen, procollagen, type XVI, alpha 1, A530052M23Rik, 2700007F12Rik, CA1F, Col16a1, AI838662

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:7.17 小脳:6.97 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.16 脊柱:8.14 網膜:7.11 目:7.80 動脈:- 静脈:10.49 リンパ節:7.26 末梢血:- 脾臓:7.49 胸腺:- 骨髄:6.60 脂肪:7.57 骨:7.75 皮膚:9.11
CAGE 大脳:1.32 小脳:- 脳幹:2.20 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.29 網膜:- 目:- 動脈:2.71 静脈:- リンパ節:1.78 末梢血:- 脾臓:1.76 胸腺:1.26 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.77 皮膚:4.59
RNA-seq 大脳:1.75 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:9.95 胎盤:7.57 前立腺:8.28 卵巣:8.81 精巣:9.61 心臓:7.57 骨格筋:7.40 食道:- 胃:7.52 腸:7.45 結腸:- 肝臓:7.02 肺:7.89 膀胱:8.98 腎臓:7.20 下垂体:7.18 甲状腺:- 副腎:8.01 膵臓:7.06 乳腺:8.48 唾液腺:7.76
CAGE 子宮:4.68 胎盤:2.36 前立腺:3.38 卵巣:4.14 精巣:0.45 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.79 腸:2.06 結腸:1.93     肝臓:1.58    肺:3.08 膀胱:4.16 腎臓:- 下垂体:1.86 甲状腺:- 副腎:3.25 膵臓:2.33 乳腺:3.46 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.48 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.35        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_028266
Gene ID 107581
Unigene ID -
Probe set ID 1427986_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000040690

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_001856
ラット[1]  NM_001015033

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8650669
8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
15226823
16141072
16141073
16537572
16754661
17169544
17452023
18287559
20548288
20830809
21267068

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007155  cell adhesion
GO:0071230  cellular response to amino acid stimulus

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0005576  extracellular region
GO:0005578  proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005178  integrin binding