sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3D

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同義遺伝子名

Semaphorin-3D precursor, 4631426B19Rik, Sema3d

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:24.30 小脳:92.10 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:95.50 脊柱:47.30 網膜:- 目:53.20 動脈:337.60 静脈:- リンパ節:118.80 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:39.50 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:31.70
GeneChip nodata
CAGE 大脳:1.43 小脳:- 脳幹:2.08 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:1.96 網膜:- 目:- 動脈:3.30 静脈:- リンパ節:3.15 末梢血:- 脾臓:2.14 胸腺:1.06 骨髄:- 脂肪:- 骨:0.63 皮膚:3.53
RNA-seq 大脳:0.87 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:30.90 卵巣:- 精巣:22.20 心臓:37.20 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:30.10    膀胱:- 腎臓:56.40 下垂体:25.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:9.80 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:0.97 胎盤:0.11 前立腺:0.84 卵巣:3.61 精巣:0 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.35 腸:0.84 結腸:0.70     肝臓:0.91    肺:2.54 膀胱:2.55 腎臓:- 下垂体:0.86 甲状腺:- 副腎:0.97 膵臓:0 乳腺:1.11 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.32 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.68        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_028882
Gene ID 108151
Unigene ID Mm.89313
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000040254

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_152754
ラット[1]  NM_001104633

染色体

5A1  [12,383,166  -  12,588,943]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003659  Plexin/semaphorin/integrin
IPR001627  Semaphorin/CD100 antigen
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10843805
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
15550623
15869472
16141072
16141073
16284245
16602821
17145500
17626059
18489001
18617019
19812329
19906978
21267068
21491433
21677750
22076636
22421048
22632726
23685842
23991118

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030154  cell differentiation
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0007399  nervous system development

Cellular Component

GO:0005576  extracellular region
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0004872  receptor activity