collectin sub-family member 12

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同義遺伝子名

CL-P1, Colec12, SRCL, Scara4, collectin sub-family member 12

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:15.60 小脳:55.30 脳幹:- 脳梁:- 松果体:257.80 末梢神経:95.50 脊柱:- 網膜:- 目:22.80 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:13.20 胸腺:- 骨髄:12.80 脂肪:- 骨:200.40 皮膚:15.80
GeneChip 大脳:4.38 小脳:4.64 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:4.10 脊柱:4.19 網膜:3.81 目:5.86 動脈:- 静脈:8.78 リンパ節:6.18 末梢血:- 脾臓:5.66 胸腺:- 骨髄:4.73 脂肪:5.06 骨:5.67 皮膚:4.28
CAGE 大脳:2.54 小脳:- 脳幹:2.53 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.13 網膜:- 目:- 動脈:3.89 静脈:- リンパ節:4.02 末梢血:- 脾臓:2.75 胸腺:1.75 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.14 皮膚:2.76
RNA-seq 大脳:192.38 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:69 前立腺:30.90 卵巣:23 精巣:- 心臓:74.40 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:10    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:25.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:37.50 乳腺:29.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.59 胎盤:7.51 前立腺:5.34 卵巣:5.87 精巣:3.73 心臓:5.51 骨格筋:5 食道:- 胃:4.80 腸:4.41 結腸:- 肝臓:6.77 肺:7.61 膀胱:7.05 腎臓:4.78 下垂体:5.09 甲状腺:- 副腎:5.30 膵臓:4.74 乳腺:5.09 唾液腺:6.22
CAGE 子宮:3.56 胎盤:3.85 前立腺:2.24 卵巣:3.41 精巣:0.99 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.26 腸:2.33 結腸:1.93     肝臓:4.06    肺:4.50 膀胱:3.94 腎臓:- 下垂体:3.20 甲状腺:- 副腎:3.03 膵臓:2.90 乳腺:2.33 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:454.93 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:5.03        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_130449
Gene ID 140792
Unigene ID Mm.218571
Probe set ID 1419693_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000036103

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_130386
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001304  C-type lectin
IPR016187  C-type lectin fold
IPR016186  C-type lectin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
11042159
11076861
11217851
11564734
11718900
12466851
12477932
16141072
16141073
17420244
18973680
19073604
21267068

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006955  immune response
GO:0002221  pattern recognition receptor signaling pathway
GO:0006910  phagocytosis, recognition

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0016021  integral to membrane
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0030246  carbohydrate binding
GO:0030169  low-density lipoprotein binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0008329  pattern recognition receptor activity