mutS homolog 3 (E. coli)

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同義遺伝子名

Rep-3, D13Em1, Repair-3 protein, Msh3, Rep3, DNA mismatch repair protein Msh3, REP-1, mutS homolog 3 (E. coli)

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:67.70 小脳:36.80 脳幹:95.30 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:38.20 脊柱:- 網膜:- 目:30.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:54 末梢血:28.80 脾臓:52.70 胸腺:118.60 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:23.80
GeneChip 大脳:6.54 小脳:6.43 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:6.60 脊柱:6.54 網膜:7.21 目:6.50 動脈:- 静脈:6.34 リンパ節:6.81 末梢血:- 脾臓:6.38 胸腺:- 骨髄:7.44 脂肪:6.62 骨:7.07 皮膚:6.76
CAGE 大脳:2.66 小脳:- 脳幹:2.51 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.51 網膜:- 目:- 動脈:2.55 静脈:- リンパ節:3.10 末梢血:- 脾臓:2.73 胸腺:3.11 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.66 皮膚:2.90
RNA-seq 大脳:1.85 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:13.80 前立腺:- 卵巣:80.40 精巣:29.60 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:10    膀胱:66.20 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:18.80 乳腺:62 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.45 胎盤:6.34 前立腺:5.73 卵巣:6.54 精巣:7.52 心臓:6.28 骨格筋:6.78 食道:- 胃:5.99 腸:6.43 結腸:- 肝臓:6.28 肺:5.73 膀胱:5.84 腎臓:6.73 下垂体:6.99 甲状腺:- 副腎:7.08 膵臓:6.19 乳腺:6.54 唾液腺:6.34
CAGE 子宮:2.34 胎盤:1.54 前立腺:1.80 卵巣:2.69 精巣:1.89 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.91 腸:2.49 結腸:2.46     肝臓:2.55    肺:2.36 膀胱:2.14 腎臓:- 下垂体:2.79 甲状腺:- 副腎:2.29 膵臓:2.56 乳腺:2.37 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.72 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.32        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_010829
Gene ID 17686
Unigene ID Mm.343101
Probe set ID 1424166_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000014850

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_002439
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000432  DNA mismatch repair protein MutS, C-terminal

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2233729
2674679
2722860
2982814
7926796
8782829
10349636
10545954
10662804
10706084
11042159
11076861
11125038
11217851
11223406
11691815
11809728
12466851
12477932
12520002
12612914
14610273
15238604
15238605
15317747
16141072
16141073
16260499
16437133
16552576
16618598
16728433
16964442
17142234
18799693
21344488
21690297
22174455
22289650
23468640
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006281  DNA repair
GO:0043570  maintenance of DNA repeat elements
GO:0000710  meiotic mismatch repair
GO:0006298  mismatch repair
GO:0045910  negative regulation of DNA recombination
GO:0051096  positive regulation of helicase activity
GO:0007131  reciprocal meiotic recombination
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0016446  somatic hypermutation of immunoglobulin genes
GO:0016447  somatic recombination of immunoglobulin gene segments

Cellular Component

GO:0032302  MutSbeta complex
GO:0000228  nuclear chromosome
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0019237  centromeric DNA binding
GO:0003684  damaged DNA binding
GO:0032139  dinucleotide insertion or deletion binding
GO:0032181  dinucleotide repeat insertion binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0008094  DNA-dependent ATPase activity
GO:0000406  double-strand/single-strand DNA junction binding
GO:0019899  enzyme binding
GO:0000404  loop DNA binding
GO:0030983  mismatched DNA binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0032142  single guanine insertion binding
GO:0003697  single-stranded DNA binding
GO:0000403  Y-form DNA binding