SLU7 splicing factor homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

D3Bwg0878e, MGC31026, D11Ertd730e, AU018913

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.95 小脳:6.74 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7 脊柱:6.65 網膜:7.13 目:6.99 動脈:- 静脈:6.54 リンパ節:6.39 末梢血:- 脾臓:6.59 胸腺:- 骨髄:6.45 脂肪:6.51 骨:6.43 皮膚:6.49
CAGE 大脳:3.70 小脳:- 脳幹:3.80 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.78 網膜:- 目:- 動脈:3.55 静脈:- リンパ節:4.13 末梢血:- 脾臓:3.24 胸腺:3.47 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.69 皮膚:3.86
RNA-seq 大脳:4.99 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.66 胎盤:6.39 前立腺:6.20 卵巣:6.34 精巣:6.28 心臓:6.52 骨格筋:6.51 食道:- 胃:6.42 腸:6.44 結腸:- 肝臓:5.90 肺:6.70 膀胱:6.69 腎臓:6.43 下垂体:6.32 甲状腺:- 副腎:6.54 膵臓:6.68 乳腺:6.54 唾液腺:5.93
CAGE 子宮:3.48 胎盤:3.56 前立腺:3.78 卵巣:3.22 精巣:4.46 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.29 腸:3.13 結腸:3.35     肝臓:3.21    肺:3.79 膀胱:3.58 腎臓:- 下垂体:3.73 甲状腺:- 副腎:3.45 膵臓:3.41 乳腺:3.22 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:4.20 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.84        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_198936
Gene ID 193116
Unigene ID -
Probe set ID 1425489_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000020409

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_006425
ラット[1]  NM_001100550

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
9371744
10349636
10647016
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
11238888
11544199
12466851
12477932
14610273
16141072
16141073
17804646
21677750
22922362

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000380  alternative nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0033554  cellular response to stress
GO:0006886  intracellular protein transport
GO:0006397  mRNA processing
GO:0000389  nuclear mRNA 3'-splice site recognition
GO:0008380  RNA splicing
GO:0000375  RNA splicing, via transesterification reactions

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737  cytoplasm
GO:0043231  intracellular membrane-bounded organelle
GO:0016607  nuclear speck
GO:0005634  nucleus
GO:0030532  small nuclear ribonucleoprotein complex
GO:0005681  spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0046872  metal ion binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0030628  pre-mRNA 3'-splice site binding
GO:0000386  second spliceosomal transesterification activity
GO:0008270  zinc ion binding