UPF1 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast)

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同義遺伝子名

B430202H16Rik, Upf1, Rent1, ATP-dependent helicase RENT1, PNORF-1, mUpf1, NORF1, Regulator of nonsense transcripts 1, Up-frameshift suppressor 1 homolog, Nonsense mRNA reducing factor 1, Upflp

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:34.70 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:7.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:9.90 骨髄:- 脂肪:425.40 骨:12.50 皮膚:7.90
GeneChip 大脳:5.96 小脳:6.35 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.90 脊柱:5.68 網膜:5.52 目:5.35 動脈:- 静脈:5.74 リンパ節:6.46 末梢血:- 脾臓:6.90 胸腺:- 骨髄:6.79 脂肪:5.89 骨:6.29 皮膚:6.06
CAGE 大脳:4.05 小脳:- 脳幹:3.70 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.65 網膜:- 目:- 動脈:3.71 静脈:- リンパ節:3.83 末梢血:- 脾臓:4.10 胸腺:4.24 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.24 皮膚:4.28
RNA-seq 大脳:9.98 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:27.60 前立腺:- 卵巣:103.40 精巣:7.40 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17.60     肝臓:36.20        肺:20.10    膀胱:- 腎臓:8.10 下垂体:439.20 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:16.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.81 胎盤:5.76 前立腺:7.02 卵巣:6.54 精巣:7.53 心臓:5.97 骨格筋:6.06 食道:- 胃:6.42 腸:6.94 結腸:- 肝臓:6.38 肺:6.42 膀胱:6.28 腎臓:6.25 下垂体:6.28 甲状腺:- 副腎:6.92 膵臓:6.12 乳腺:5.92 唾液腺:6.85
CAGE 子宮:3.92 胎盤:3.79 前立腺:4.12 卵巣:3.80 精巣:4.95 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.09 腸:4.26 結腸:4.09     肝臓:4.19    肺:3.89 膀胱:3.95 腎臓:- 下垂体:3.95 甲状腺:- 副腎:3.90 膵臓:3.99 乳腺:3.76 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:4.66 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:5.13        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001122829
Gene ID 19704
Unigene ID Mm.390048
Probe set ID 1419685_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000058301

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_002911
ラット[2]  NM_002911

染色体

8B3.3  [72,855,421  -  72,877,172]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8855285
8889548
9231034
10349636
11042159
11076861
11152657
11217851
11353399
12466851
12477932
12520002
12904583
15489334
15782199
16141072
16141073
16789828
17000771
21670277
22083510
22503102
23766421
23821644
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007049  cell cycle
GO:0006281  DNA repair
GO:0006260  DNA replication
GO:0009048  dosage compensation, by inactivation of X chromosome
GO:0071044  histone mRNA catabolic process
GO:0000184  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0006449  regulation of translational termination

Cellular Component

GO:0000785  chromatin
GO:0005737  cytoplasm
GO:0035145  exon-exon junction complex
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0004004  ATP-dependent RNA helicase activity
GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0004386  helicase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0008270  zinc ion binding