helicase-like transcription factor

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同義遺伝子名

BC057116, P113, Snf2l3, Zbu1, AF010600, Smarca3, TNF-response element-binding protein, Hltf, Sucrose nonfermenting protein 2-like 3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:20.80 小脳:18.40 脳幹:127.10 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:76.40 脊柱:47.30 網膜:- 目:45.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:75.60 末梢血:57.50 脾臓:39.50 胸腺:187.70 骨髄:51.30 脂肪:- 骨:37.60 皮膚:31.70
GeneChip 大脳:5.19 小脳:5.92 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:4.95 脊柱:5.23 網膜:4.86 目:4.77 動脈:- 静脈:5.29 リンパ節:6.97 末梢血:- 脾臓:7.15 胸腺:- 骨髄:6.64 脂肪:5.33 骨:6.04 皮膚:5.47
CAGE 大脳:2.93 小脳:- 脳幹:3.07 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.07 網膜:- 目:- 動脈:2.90 静脈:- リンパ節:4.34 末梢血:- 脾臓:3.28 胸腺:3.42 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.06 皮膚:3.31
RNA-seq 大脳:0.93 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:13.80 前立腺:- 卵巣:11.50 精巣:14.80 心臓:74.40 骨格筋:35.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:35.20     肝臓:-        肺:30.10    膀胱:132.40 腎臓:- 下垂体:25.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:46.90 乳腺:58.80 唾液腺:54
GeneChip 子宮:5.24 胎盤:6.03 前立腺:4.79 卵巣:5.77 精巣:4.58 心臓:5.06 骨格筋:4.37 食道:- 胃:5.33 腸:5.58 結腸:- 肝臓:4.72 肺:5.69 膀胱:5.68 腎臓:5.62 下垂体:6.20 甲状腺:- 副腎:5.26 膵臓:5.29 乳腺:5.60 唾液腺:4.71
CAGE 子宮:2.96 胎盤:2.90 前立腺:3.12 卵巣:3.10 精巣:2.12 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.52 腸:2.62 結腸:3.18     肝臓:2.26    肺:3.43 膀胱:3.13 腎臓:- 下垂体:3.32 甲状腺:- 副腎:2.94 膵臓:2.97 乳腺:3.16 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.31 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.68        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_009210
Gene ID 20585
Unigene ID Mm.209650
Probe set ID 1425996_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000002428

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_003071, NM_139048
ラット[1]  NM_001106478, NM_139048

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9126292
9427542
10349636
11042159
11076861
11217851
11707070
12466851
12477932
14681479
15489334
15618518
16141072
16141073
17208939
18287559
20059953
20211142
20412781
21267068
21677750
22452792
23415230
23826137
24278285

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006200  ATP catabolic process
GO:0016568  chromatin modification
GO:0008152  metabolic process
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0016887  ATPase activity
GO:0003824  catalytic activity
GO:0003677  DNA binding
GO:0004386  helicase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0016818  hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides
GO:0016874  ligase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0008270  zinc ion binding