Smg-7 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans)

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

Kiaa0250, mKIAA0250, EST1-like protein C, Est1c, Smg7, 9430023P16Rik, MGC91209, SMG-7 homolog, Protein SMG7

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:69.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:64.30 目:91.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:28.80 脾臓:26.30 胸腺:69.20 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.50 皮膚:79.20
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.66 小脳:- 脳幹:3.41 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.70 網膜:- 目:- 動脈:3.45 静脈:- リンパ節:4.36 末梢血:- 脾臓:3.41 胸腺:3.64 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.18 皮膚:3.58
RNA-seq 大脳:5.39 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:69 前立腺:- 卵巣:- 精巣:73.90 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:65.50 腸:73.90 結腸:52.90     肝臓:9.10        肺:20.10    膀胱:- 腎臓:24.20 下垂体:25.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:19.60 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.45 胎盤:3.28 前立腺:2.90 卵巣:3.34 精巣:3.88 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.95 腸:3.38 結腸:3.26     肝臓:2.95    肺:3.35 膀胱:3.19 腎臓:- 下垂体:3.58 甲状腺:- 副腎:3.18 膵臓:3.10 乳腺:2.94 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.49 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.05        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001160257
Gene ID 226517
Unigene ID Mm.270775
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000042772

オーソログ対応遺伝子

ヒト[9]  NM_001174061, NM_173156, NM_201568, NM_201569
ラット [0]  

染色体

1G3  [154,684,126  -  154,749,776]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
12904583
14610273
14621295
15489334
16141072
16141073
18799693

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008150  biological_process
GO:0000184  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0045111  intermediate filament cytoskeleton
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0051721  protein phosphatase 2A binding