leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1

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同義遺伝子名

Lrsam1, Ubiquitin ligase protein LRSAM1, Tsg101-associated ligase, MGC56830

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.05 小脳:- 脳幹:3.22 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.33 網膜:- 目:- 動脈:2.58 静脈:- リンパ節:2.01 末梢血:- 脾臓:1.89 胸腺:1.99 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.30 皮膚:2.58
RNA-seq 大脳:5.22 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.26 胎盤:2.82 前立腺:2.54 卵巣:2.37 精巣:1.48 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.75 腸:1.99 結腸:2.32     肝臓:2.20    肺:2.48 膀胱:2.79 腎臓:- 下垂体:2.68 甲状腺:- 副腎:2.52 膵臓:1.61 乳腺:2.14 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.93 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.13        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_199302
Gene ID 227738
Unigene ID -
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000026792

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]  NM_001005373, NM_001005374, NM_001190723, NM_138361
ラット[1]  NM_001107833, NM_001005374, NM_001190723, NM_138361

染色体

2B  [32,780,740  -  32,817,134]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001660  Sterile alpha motif
IPR010993  Sterile alpha motif homology
IPR013761  Sterile alpha motif-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10922068
12477932
12520002
14610273
15256501
15489334
15618518
15782199
16141072
17967808
18799693
21267068
21677750
23519028

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0045806  negative regulation of endocytosis
GO:0046755  non-lytic virus budding
GO:0051865  protein autoubiquitination
GO:0030163  protein catabolic process
GO:0000209  protein polyubiquitination
GO:0015031  protein transport
GO:0006810  transport
GO:0070086  ubiquitin-dependent endocytosis

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0044425  membrane part

Molecular Function

GO:0016874  ligase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270  zinc ion binding