DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58

同義遺伝子名

Ddx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, C330021E21, RIG-I, 6430573D20Rik, RIG-1, DEAD-box protein 58, Retinoic acid-inducible gene 1 protein, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:22.80

動脈:84.40

静脈:-

リンパ節:118.80

末梢血:57.50

脾臓:65.80

胸腺:69.20

骨髄:25.60

脂肪:-

骨:25

皮膚:-

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:1.65

小脳:-

脳幹:1.95

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:1.94

網膜:-

目:-

動脈:3.84

静脈:-

リンパ節:4.87

末梢血:-

脾臓:3.40

胸腺:3.45

骨髄:-

脂肪:-

骨:3.44

皮膚:2.92

RNA-seq

大脳:0.98

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:87.20

胎盤:13.80

前立腺:30.90

卵巣:-

精巣:36.90

心臓:37.20

骨格筋:35.50

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:60.30

膀胱:-

腎臓:56.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:9.40

乳腺:58.80

唾液腺:54

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:4.03

胎盤:3.53

前立腺:2.56

卵巣:3.18

精巣:1.48

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:2.73

腸:4.27

結腸:3.75

肝臓:3.27

肺:4.10

膀胱:3.47

腎臓:-

下垂体:2.83

甲状腺:-

副腎:3.68

膵臓:1.84

乳腺:3.39

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:1.42

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:3.49

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_172689
Gene ID	230073
Unigene ID	Mm.86382
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSMUSG00000040296

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]	NM_014314
ラット[1]	NM_001106645

染色体

4A5 [40,150,806 - 40,186,861]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0051607	defense response to virus
GO:0009597	detection of virus
GO:0045087	innate immune response
GO:0002230	positive regulation of defense response to virus by host
GO:0032727	positive regulation of interferon-alpha production
GO:0032728	positive regulation of interferon-beta production
GO:0042993	positive regulation of transcription factor import into nucleus
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0030334	regulation of cell migration
GO:0043330	response to exogenous dsRNA
GO:0009615	response to virus

Cellular Component

GO:0015629	actin cytoskeleton
GO:0030054	cell junction
GO:0042995	cell projection
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005856	cytoskeleton
GO:0016020	membrane
GO:0005886	plasma membrane
GO:0032587	ruffle membrane
GO:0005923	tight junction

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0008026	ATP-dependent helicase activity
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0003725	double-stranded RNA binding
GO:0004386	helicase activity
GO:0016787	hydrolase activity
GO:0016817	hydrolase activity, acting on acid anhydrides
GO:0042802	identical protein binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0003676	nucleic acid binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding
GO:0003727	single-stranded RNA binding
GO:0008270	zinc ion binding

DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function