LSM2 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

SmX5, D17H6S56E-2, snRNP, Lsm2, Dmapl, D17H6S56E2, Sm-X5, MGC13889, Dmpkap

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:31.30

小脳:36.80

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:76.40

脊柱:-

網膜:-

目:15.20

動脈:-

静脈:-

リンパ節:32.40

末梢血:14.40

脾臓:92.20

胸腺:158.10

骨髄:25.60

脂肪:-

骨:50.10

皮膚:7.90

GeneChip

大脳:5.75

小脳:6.04

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:5.42

脊柱:5.61

網膜:4.28

目:4.39

動脈:-

静脈:7.13

リンパ節:7.50

末梢血:-

脾臓:7.11

胸腺:-

骨髄:8.54

脂肪:6.48

骨:7.80

皮膚:5.71

CAGE

大脳:3.41

小脳:-

脳幹:3.16

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:3.19

網膜:-

目:-

動脈:3.63

静脈:-

リンパ節:4.30

末梢血:-

脾臓:4.66

胸腺:4.55

骨髄:-

脂肪:-

骨:4.29

皮膚:4.06

RNA-seq

大脳:6.04

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:87.20

胎盤:165.70

前立腺:30.90

卵巣:34.50

精巣:133

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:37

結腸:-

肝臓:36.20

肺:70.30

膀胱:-

腎臓:8.10

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:65.70

乳腺:49

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.33

胎盤:6.67

前立腺:6.54

卵巣:6.88

精巣:10.08

心臓:5.89

骨格筋:7.23

食道:-

胃:7.05

腸:7.22

結腸:-

肝臓:7.04

肺:6.61

膀胱:5.95

腎臓:6.42

下垂体:5.80

甲状腺:-

副腎:5.97

膵臓:5.78

乳腺:7.07

唾液腺:5.76

CAGE

子宮:4.03

胎盤:4.19

前立腺:3.59

卵巣:3.83

精巣:6.38

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:4.01

腸:4.42

結腸:3.92

肝臓:3.94

肺:3.57

膀胱:3.54

腎臓:-

下垂体:3.25

甲状腺:-

副腎:3.55

膵臓:3.04

乳腺:4.16

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:3.34

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:5.24

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_030597
Gene ID	27756
Unigene ID	Mm.165735
Probe set ID	1451884_a_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000007050

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]	NM_021177
ラット[1]	NM_021177

染色体

17B1 [35,118,807 - 35,122,836]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163	Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649	Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type
IPR016654	U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000244	assembly of spliceosomal tri-snRNP
GO:0006402	mRNA catabolic process
GO:0006397	mRNA processing
GO:0008380	RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0030529	ribonucleoprotein complex
GO:0005681	spliceosomal complex
GO:0046540	U4/U6 x U5 tri-snRNP complex

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0019901	protein kinase binding
GO:0003723	RNA binding

LSM2 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function