CCR4-NOT transcription complex, subunit 4

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同義遺伝子名

Potential transcriptional repressor NOT4Hp, Not4, Not4hp, Cnot4, CCR4-associated factor 4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, Not4h, E3 ubiquitin protein ligase CNOT4, CCR4-NOT transcription complex, subunit 4

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:39.90 小脳:55.30 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:76.40 脊柱:47.30 網膜:- 目:45.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:21.60 末梢血:14.40 脾臓:39.50 胸腺:19.80 骨髄:38.50 脂肪:- 骨:50.10 皮膚:134.60
GeneChip 大脳:7.30 小脳:7.43 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.55 脊柱:6.93 網膜:7.69 目:7.55 動脈:- 静脈:7.80 リンパ節:7.83 末梢血:- 脾臓:7.96 胸腺:- 骨髄:8.38 脂肪:7.33 骨:8.21 皮膚:7.86
CAGE 大脳:4.47 小脳:- 脳幹:4.14 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.25 網膜:- 目:- 動脈:4.41 静脈:- リンパ節:5.66 末梢血:- 脾臓:4.26 胸腺:4.53 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.99 皮膚:4.79
RNA-seq 大脳:3.52 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:130.90 胎盤:13.80 前立腺:61.80 卵巣:172.40 精巣:96.10 心臓:37.20 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:35.20     肝臓:9.10        肺:70.30    膀胱:132.40 腎臓:8.10 下垂体:245.40 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:9.40 乳腺:39.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.04 胎盤:7.22 前立腺:8.03 卵巣:7.58 精巣:9.63 心臓:7.79 骨格筋:7.98 食道:- 胃:7.60 腸:7.75 結腸:- 肝臓:7.18 肺:7.67 膀胱:7.78 腎臓:7.47 下垂体:7.79 甲状腺:- 副腎:8.12 膵臓:7.48 乳腺:7.63 唾液腺:7.71
CAGE 子宮:4.14 胎盤:3.80 前立腺:3.86 卵巣:4.19 精巣:5.47 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.21 腸:3.62 結腸:3.92     肝臓:3.78    肺:4.37 膀胱:4.12 腎臓:- 下垂体:4.03 甲状腺:- 副腎:4.01 膵臓:3.89 乳腺:3.69 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.89        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001164412
Gene ID 53621
Unigene ID Mm.214525
Probe set ID 1436645_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000038784

オーソログ対応遺伝子

ヒト[6]  NM_001008225, NM_001190847, NM_001190848, NM_001190849, NM_001190850, NM_013316
ラット[1]  NM_001037782, NM_001190847, NM_001190848, NM_001190849, NM_001190850, NM_013316

染色体

6B1  [34,972,066  -  35,083,737]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1
IPR003954  RNA recognition, domain 1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
11389549
12466851
12477932
12520002
12904583
14610273
14681479
15226823
15489334
15618518
15782199
16033648
16141072
16141073
18287559
18799693
20059953
21677750

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051865  protein autoubiquitination
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0030014  CCR4-NOT complex
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0016874  ligase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270  zinc ion binding