SWI/SNF related matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a-like 1

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同義遺伝子名

Harp, Mharp, HepA-related protein, Sucrose nonfermenting protein 2-like 1, mharp, Smarcal1, 6030401P21Rik

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:97.20 小脳:202.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:76.40 脊柱:141.90 網膜:96.40 目:91.20 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:43.20 末梢血:115 脾臓:52.70 胸腺:187.70 骨髄:25.60 脂肪:425.40 骨:62.60 皮膚:71.30
GeneChip 大脳:7.84 小脳:8.01 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8 脊柱:7.74 網膜:7.03 目:7.29 動脈:- 静脈:7.71 リンパ節:8.17 末梢血:- 脾臓:7.79 胸腺:- 骨髄:8.06 脂肪:7.66 骨:7.81 皮膚:7.34
CAGE 大脳:3.46 小脳:- 脳幹:3.63 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.40 網膜:- 目:- 動脈:2.80 静脈:- リンパ節:3.33 末梢血:- 脾臓:2.75 胸腺:3.01 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.10 皮膚:2.75
RNA-seq 大脳:5.37 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:13.80 前立腺:- 卵巣:103.40 精巣:103.50 心臓:93 骨格筋:- 食道:- 胃:32.70 腸:- 結腸:17.60     肝臓:117.70        肺:90.40    膀胱:- 腎臓:16.10 下垂体:142.10 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:56.30 乳腺:35.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.05 胎盤:7.76 前立腺:7.57 卵巣:8.29 精巣:7.16 心臓:8.14 骨格筋:8.66 食道:- 胃:7.16 腸:7.21 結腸:- 肝臓:7.29 肺:7.86 膀胱:7.96 腎臓:7.66 下垂体:8.60 甲状腺:- 副腎:7.81 膵臓:7.11 乳腺:7.75 唾液腺:7.15
CAGE 子宮:2.86 胎盤:2.79 前立腺:2.37 卵巣:3.08 精巣:2.46 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.75 腸:2.19 結腸:2.22     肝臓:2.29    肺:2.97 膀胱:2.94 腎臓:- 下垂体:3.36 甲状腺:- 副腎:3.23 膵臓:2.33 乳腺:2.43 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:4.03 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.31        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018817
Gene ID 54380
Unigene ID Mm.274232
Probe set ID 1416620_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000039354

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001127207, NM_014140
ラット[1]  NM_001108222, NM_014140

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10857751
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
15489334
16141072
16141073
16602821
18287559
18799693
19793861
19793863
21677750
22378147
22888040

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006200  ATP catabolic process
GO:0016568  chromatin modification
GO:0006259  DNA metabolic process
GO:0000733  DNA strand renaturation
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0008094  DNA-dependent ATPase activity
GO:0004386  helicase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding