zinc finger CCHC-type and RNA binding motif 1

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同義遺伝子名

Madp-1, zinc finger CCHC-type and RNA binding motif 1, MADP-1, 2700088M22Rik, Zcrb1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:38.20 小脳:73.70 脳幹:63.60 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:38.20 脊柱:47.30 網膜:64.30 目:53.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:75.60 末梢血:- 脾臓:13.20 胸腺:108.70 骨髄:51.30 脂肪:- 骨:87.70 皮膚:31.70
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.58 小脳:- 脳幹:3.78 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.97 網膜:- 目:- 動脈:3.59 静脈:- リンパ節:3.56 末梢血:- 脾臓:3.22 胸腺:3.26 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.28 皮膚:3.62
RNA-seq 大脳:15.45 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:41.40 前立腺:30.90 卵巣:57.50 精巣:44.30 心臓:55.80 骨格筋:35.50 食道:- 胃:32.70 腸:73.90 結腸:35.20     肝臓:18.10        肺:10    膀胱:- 腎臓:16.10 下垂体:167.90 甲状腺:112.50 副腎:- 膵臓:56.30 乳腺:26.10 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.09 胎盤:3.40 前立腺:3.42 卵巣:3.06 精巣:4.32 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.89 腸:3.05 結腸:3.24     肝臓:3.40    肺:3.43 膀胱:3.31 腎臓:- 下垂体:3.56 甲状腺:- 副腎:3.15 膵臓:3.04 乳腺:3.43 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:40.80 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:6.71        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_026025
Gene ID 67197
Unigene ID Mm.293181
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000022635

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_033114
ラット[1]  NM_001034940

染色体

15E3  [93,216,528  -  93,228,765]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1
IPR003954  RNA recognition, domain 1
IPR001878  Zinc finger, CCHC-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
14610273
15489334
16033648
16141072
16141073
16959469

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006397  mRNA processing
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex
GO:0005689  U12-type spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0046872  metal ion binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0008270  zinc ion binding