splicing factor 3a, subunit 1

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同義遺伝子名

1200014H24Rik, SF3a120, AI159724, Sf3a1, Splicing factor 3 subunit 1, 5930416L09Rik, splicing factor 3a, subunit 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.25 小脳:6.45 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:6.65 脊柱:6.02 網膜:6.96 目:6.61 動脈:- 静脈:5.78 リンパ節:6.15 末梢血:- 脾臓:5.77 胸腺:- 骨髄:6.78 脂肪:5.12 骨:6.36 皮膚:5.62
CAGE 大脳:4.33 小脳:- 脳幹:4.12 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.13 網膜:- 目:- 動脈:3.86 静脈:- リンパ節:4.78 末梢血:- 脾臓:4.44 胸腺:4.60 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.04 皮膚:4.14
RNA-seq 大脳:13.95 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.08 胎盤:5.29 前立腺:6.03 卵巣:6.16 精巣:7.08 心臓:5.49 骨格筋:5.47 食道:- 胃:5.55 腸:5.87 結腸:- 肝臓:5.07 肺:5.72 膀胱:5.92 腎臓:5.51 下垂体:5.63 甲状腺:- 副腎:5.28 膵臓:5.37 乳腺:5.42 唾液腺:5.50
CAGE 子宮:4.09 胎盤:4.00 前立腺:3.83 卵巣:4.26 精巣:5.18 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.72 腸:4.42 結腸:4.00     肝臓:3.65    肺:4.05 膀胱:4.08 腎臓:- 下垂体:4.30 甲状腺:- 副腎:3.84 膵臓:3.86 乳腺:4.08 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.51 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.72        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_026175
Gene ID 67465
Unigene ID -
Probe set ID 1419087_s_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000002129

オーソログ対応遺伝子

ヒト[6]  NM_001005409, NM_005877
ラット[1]  NM_001107235, NM_005877

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000626  Ubiquitin
IPR019955  Ubiquitin supergroup

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
15489334
15761153
15782199
16033648
16141072
16141073
16602821
17967808
20360068
21267068
21677750
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006397  mRNA processing
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0006396  RNA processing
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex
GO:0005684  U2-type spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0003723  RNA binding