SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 2

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同義遺伝子名

Baf170, Smarcc2, 5930405J04Rik, BRG1-associated factor 170, SWI/SNF complex 170 kDa subunit

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 大脳:4.34 小脳:- 脳幹:4.01 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.20 網膜:- 目:- 動脈:4.21 静脈:- リンパ節:4.58 末梢血:- 脾臓:3.64 胸腺:3.56 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.62 皮膚:3.93
RNA-seq 大脳:30.63 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.80 胎盤:3.35 前立腺:3.95 卵巣:3.89 精巣:3.39 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.54 腸:3.27 結腸:3.77     肝臓:3.18    肺:4.06 膀胱:3.69 腎臓:- 下垂体:3.73 甲状腺:- 副腎:3.80 膵臓:3.68 乳腺:3.76 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:5.17 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:7.63        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_001114096
Gene ID 68094
Unigene ID -
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000025369

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_001130420, NM_003075, NM_139067
ラット[4]  NM_001130420, NM_003075, NM_139067

染色体

10D3  [127,896,292  -  127,927,229]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953  Chromo domain
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related
IPR017877  MYB-like
IPR001005  SANT, DNA-binding

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12368262
12466851
12477932
14610273
15345747
15489334
15782199
16141072
16141073
16452087
17640523
18287559
18799693
19279220
20362541
21076395
21267068
22083510
22325351
22513373
22922362
23643363
23785148

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007399  nervous system development
GO:0006337  nucleosome disassembly
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0016514  SWI/SNF complex
GO:0017053  transcriptional repressor complex

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0005515  protein binding