DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54

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同義遺伝子名

APR-5, DP97, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54, DEAD box protein 54, Ddx54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, 2410015A15Rik, AI414901

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:112.90 小脳:36.80 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:257.80 末梢神経:114.70 脊柱:189.10 網膜:32.10 目:53.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:32.40 末梢血:14.40 脾臓:52.70 胸腺:88.90 骨髄:38.50 脂肪:212.70 骨:263 皮膚:190
GeneChip 大脳:8.24 小脳:7.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.02 脊柱:7.95 網膜:8.42 目:8.89 動脈:- 静脈:8.86 リンパ節:9.73 末梢血:- 脾臓:10.01 胸腺:- 骨髄:9.09 脂肪:8.59 骨:9.25 皮膚:9.17
CAGE 大脳:2.69 小脳:- 脳幹:2.89 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.91 網膜:- 目:- 動脈:2.93 静脈:- リンパ節:3.16 末梢血:- 脾臓:3.41 胸腺:3.17 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.32 皮膚:3.31
RNA-seq 大脳:8.22 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:174.50 胎盤:165.70 前立腺:- 卵巣:34.50 精巣:118.20 心臓:93 骨格筋:106.50 食道:- 胃:65.50 腸:- 結腸:88.10     肝臓:208.20        肺:110.50    膀胱:66.20 腎臓:137 下垂体:167.90 甲状腺:112.50 副腎:- 膵臓:18.80 乳腺:114.30 唾液腺:108
GeneChip 子宮:8.93 胎盤:8.89 前立腺:9.12 卵巣:8.62 精巣:7.95 心臓:8.48 骨格筋:8.57 食道:- 胃:8.93 腸:9.16 結腸:- 肝臓:8.65 肺:8.69 膀胱:8.79 腎臓:8.63 下垂体:8.15 甲状腺:- 副腎:8.99 膵臓:10.17 乳腺:9 唾液腺:9.39
CAGE 子宮:3.35 胎盤:3.39 前立腺:3.53 卵巣:3.08 精巣:3.29 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.05 腸:3.35 結腸:3.42     肝臓:3.18    肺:3.35 膀胱:2.82 腎臓:- 下垂体:2.83 甲状腺:- 副腎:3.31 膵臓:3.21 乳腺:3.48 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:3.78 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:7.60        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_028041
Gene ID 71990
Unigene ID Mm.24495
Probe set ID 1438853_x_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000029599

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001111322, NM_024072
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
15489334
15782199
16141072
16141073
20059953
21267068
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0016070  RNA metabolic process
GO:0006396  RNA processing
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0008026  ATP-dependent helicase activity
GO:0004004  ATP-dependent RNA helicase activity
GO:0030331  estrogen receptor binding
GO:0004386  helicase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0016818  hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005102  receptor binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0003714  transcription corepressor activity