TruB pseudouridine (psi) synthase homolog 1 (E. coli)

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同義遺伝子名

C76870, MGC107612, BB118943, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, AI448235, 2610009I02Rik, 9030425C13Rik, Trub1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:33 小脳:55.30 脳幹:95.30 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:76.40 脊柱:94.60 網膜:- 目:7.60 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:- 末梢血:14.40 脾臓:26.30 胸腺:158.10 骨髄:25.60 脂肪:- 骨:37.60 皮膚:23.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.18 小脳:- 脳幹:3.17 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.01 網膜:- 目:- 動脈:3.08 静脈:- リンパ節:3.20 末梢血:- 脾臓:2.47 胸腺:3.02 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.29 皮膚:3.07
RNA-seq 大脳:3.18 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:13.80 前立腺:- 卵巣:46 精巣:51.70 心臓:18.60 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:147.90 結腸:52.90     肝臓:81.50        肺:-    膀胱:66.20 腎臓:64.50 下垂体:12.90 甲状腺:112.50 副腎:424.40 膵臓:- 乳腺:26.10 唾液腺:54
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.02 胎盤:2.66 前立腺:2.57 卵巣:3.25 精巣:1.97 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.95 腸:2.56 結腸:2.50     肝臓:3.23    肺:2.41 膀胱:2.86 腎臓:- 下垂体:3.24 甲状腺:- 副腎:3.07 膵臓:2.66 乳腺:2.71 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.35 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.08        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_028115
Gene ID 72133
Unigene ID Mm.258404
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000025086

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_139169
ラット[1]  NM_001012173

染色体

19D2  [57,527,396  -  57,565,495]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002501  Pseudouridine synthase II, TruB, N-terminal
IPR014780  Pseudouridine synthase II, TruB, N-terminal, bacterial-type
IPR020103  Pseudouridine synthase, catalytic domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
12904583
14610273
15489334
16141072
16141073
21267068

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0001522  pseudouridine synthesis
GO:0009451  RNA modification
GO:0006396  RNA processing
GO:0008033  tRNA processing

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component

Molecular Function

GO:0016853  isomerase activity
GO:0009982  pseudouridine synthase activity
GO:0003723  RNA binding