histone deacetylase 5

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同義遺伝子名

KIAA0600, Histone deacetylase 5, NY-CO-9, HD5, HDAC5, Antigen NY-CO-9, histone deacetylase 5

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

EST 大脳:48.60 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:112.30 網膜:- 目:111.70 動脈:- 静脈:- リンパ節:80.90 末梢血:18.20 脾臓:18.90 胸腺:51.50 骨髄:78.70 脂肪:121 骨:38.40 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:7.02 小脳:6.85 脳幹:7.24 脳梁:6.85 松果体:- 末梢神経:6.47 脊柱:6.55 網膜:- 目:- 動脈:7.27 静脈:7.03 リンパ節:6.63 末梢血:- 脾臓:6.78 胸腺:6.33 骨髄:6.18 脂肪:6.85 骨:- 皮膚:7.19
CAGE 大脳:4.14 小脳:- 脳幹:4.19 脳梁:4.32 松果体:4.55 末梢神経:- 脊柱:3.67 網膜:- 目:- 動脈:4.01 静脈:3.82 リンパ節:3.15 末梢血:- 脾臓:3.37 胸腺:3.28 骨髄:- 脂肪:3.60 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.11 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.54 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.24 骨:- 皮膚:-
EST 子宮:45.60 胎盤:54.60 前立腺:33.80 卵巣:111.80 精巣:38.90 心臓:63.90 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:42.40     肝臓:10.60        肺:29.30    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:133.40 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.52 胎盤:7.57 前立腺:6.45 卵巣:6.79 精巣:6.60 心臓:6.90 骨格筋:7.19 食道:7.24 胃:6.18 腸:6.38 結腸:6.30 肝臓:6.16 肺:6.95 膀胱:- 腎臓:6.61 下垂体:7.30 甲状腺:6.90 副腎:6.75 膵臓:6.61 乳腺:6.91 唾液腺:6.57
CAGE 子宮:3.99 胎盤:4.21 前立腺:4.01 卵巣:3.89 精巣:3.57 心臓:3.74 骨格筋:3.60 食道:3.86 胃:- 腸:3.24 結腸:3.58     肝臓:2.91    肺:3.59 膀胱:4.04 腎臓:2.98 下垂体:3.76 甲状腺:3.98 副腎:- 膵臓:3.13 乳腺:4.29 唾液腺:3.24
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.76 卵巣:2.87 精巣:3.12 心臓:2.31 骨格筋:3.36 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.42     肝臓:0.00        肺:3.38    膀胱:- 腎臓:1.26 下垂体:- 甲状腺:3.32 副腎:2.56 膵臓:- 乳腺:1.92 唾液腺:-

IDs

Refseq ID NM_001015053
Gene ID 10014
Unigene ID Hs.438782
Probe set ID 202455_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000108840
GTEx ID ENSG00000108840

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001077696, NM_010412
ラット [0]  

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0042113  B cell activation
GO:0030183  B cell differentiation
GO:0032869  cellular response to insulin stimulus
GO:0016568  chromatin modification
GO:0006325  chromatin organization
GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0006342  chromatin silencing
GO:0007507  heart development
GO:0016575  histone deacetylation
GO:0006954  inflammatory response
GO:0090051  negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis
GO:0010832  negative regulation of myotube differentiation
GO:0045668  negative regulation of osteoblast differentiation
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007219  Notch signaling pathway
GO:0002076  osteoblast development
GO:0051091  positive regulation of transcription factor activity
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0010830  regulation of myotube differentiation
GO:0043393  regulation of protein binding
GO:0042220  response to cocaine
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0000118  histone deacetylase complex
GO:0016604  nuclear body
GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0044212  DNA regulatory region binding
GO:0004407  histone deacetylase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0032041  NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0046969  NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0046970  NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific)
GO:0005515  protein binding
GO:0005080  protein kinase C binding
GO:0003714  transcription corepressor activity
GO:0008134  transcription factor binding
GO:0070491  transcription repressor binding