histone deacetylase 5

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同義遺伝子名

KIAA0600, Histone deacetylase 5, NY-CO-9, HD5, HDAC5, Antigen NY-CO-9, histone deacetylase 5

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:48.60

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:112.30

網膜:-

目:111.70

動脈:-

静脈:-

リンパ節:80.90

末梢血:18.20

脾臓:18.90

胸腺:51.50

骨髄:78.70

脂肪:121

骨:38.40

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:7.02

小脳:6.85

脳幹:7.24

脳梁:6.85

松果体:-

末梢神経:6.47

脊柱:6.55

網膜:-

目:-

動脈:7.27

静脈:7.03

リンパ節:6.63

末梢血:-

脾臓:6.78

胸腺:6.33

骨髄:6.18

脂肪:6.85

骨:-

皮膚:7.19

CAGE

大脳:4.14

小脳:-

脳幹:4.19

脳梁:4.32

松果体:4.55

末梢神経:-

脊柱:3.67

網膜:-

目:-

動脈:4.01

静脈:3.82

リンパ節:3.15

末梢血:-

脾臓:3.37

胸腺:3.28

骨髄:-

脂肪:3.60

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.32

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.02

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.81

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:45.60

胎盤:54.60

前立腺:33.80

卵巣:111.80

精巣:38.90

心臓:63.90

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:42.40

肝臓:10.60

肺:29.30

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:133.40

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.52

胎盤:7.57

前立腺:6.45

卵巣:6.79

精巣:6.60

心臓:6.90

骨格筋:7.19

食道:7.24

胃:6.18

腸:6.38

結腸:6.30

肝臓:6.16

肺:6.95

膀胱:-

腎臓:6.61

下垂体:7.30

甲状腺:6.90

副腎:6.75

膵臓:6.61

乳腺:6.91

唾液腺:6.57

CAGE

子宮:3.99

胎盤:4.21

前立腺:4.01

卵巣:3.89

精巣:3.57

心臓:3.74

骨格筋:3.60

食道:3.86

胃:-

腸:3.24

結腸:3.58

肝臓:2.91

肺:3.59

膀胱:4.04

腎臓:2.98

下垂体:3.76

甲状腺:3.98

副腎:-

膵臓:3.13

乳腺:4.29

唾液腺:3.24

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.04

卵巣:2.22

精巣:1.51

心臓:1.70

骨格筋:3.74

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.88

肝臓:1.33

肺:2.73

膀胱:-

腎臓:1.34

下垂体:-

甲状腺:2.07

副腎:0.01

膵臓:-

乳腺:1.68

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005474
Gene ID	10014
Unigene ID	Hs.438782
Probe set ID	202455_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000108840
GTEx ID	ENSG00000108840

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001077696, NM_010412
ラット [0]

染色体

17q21.31 [42,154,121 - 42,201,014]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR017320	Histone deacetylase class II, eukaryotic
IPR000286	Histone deacetylase superfamily

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0042113	B cell activation
GO:0030183	B cell differentiation
GO:0032869	cellular response to insulin stimulus
GO:0016568	chromatin modification
GO:0006325	chromatin organization
GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0006342	chromatin silencing
GO:0007507	heart development
GO:0016575	histone deacetylation
GO:0006954	inflammatory response
GO:0090051	negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis
GO:0010832	negative regulation of myotube differentiation
GO:0045668	negative regulation of osteoblast differentiation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007219	Notch signaling pathway
GO:0002076	osteoblast development
GO:0051091	positive regulation of transcription factor activity
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0010830	regulation of myotube differentiation
GO:0043393	regulation of protein binding
GO:0042220	response to cocaine
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005794	Golgi apparatus
GO:0000118	histone deacetylase complex
GO:0016604	nuclear body
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0004407	histone deacetylase activity
GO:0046872	metal ion binding
GO:0032041	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0046969	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0046970	NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific)
GO:0005515	protein binding
GO:0005080	protein kinase C binding
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0008134	transcription factor binding
GO:0070491	transcription repressor binding

histone deacetylase 5

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function