cadherin 4, type 1, R-cadherin (retinal)

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同義遺伝子名

R-cadherin, CDH4, CAD4, MGC126700, FLJ40547, Retinal-cadherin, RCAD, FLJ22202, MGC138355, Cadherin-4 precursor, R-CAD, cadherin 4, type 1, R-cadherin (retinal)

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:46.20 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:148.30 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:29.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:37.80 胸腺:25.80 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:52.80
GeneChip 大脳:5.69 小脳:4.86 脳幹:5.13 脳梁:5.32 松果体:- 末梢神経:5.35 脊柱:4.95 網膜:- 目:- 動脈:4.53 静脈:4.95 リンパ節:4.55 末梢血:- 脾臓:5.82 胸腺:3.98 骨髄:4.79 脂肪:4.65 骨:- 皮膚:4.56
CAGE 大脳:2.36 小脳:- 脳幹:1.53 脳梁:2.05 松果体:0.51 末梢神経:- 脊柱:1.53 網膜:- 目:- 動脈:0.34 静脈:0.70 リンパ節:0.12 末梢血:- 脾臓:2.33 胸腺:0.18 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.02 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.02 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:111.80 精巣:30.30 心臓:- 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:25.40     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:26.70 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.47 胎盤:4.47 前立腺:4.23 卵巣:4.60 精巣:4.59 心臓:4.71 骨格筋:4.87 食道:4.54 胃:4.50 腸:4.79 結腸:4.81 肝臓:4.40 肺:4.56 膀胱:- 腎臓:4.44 下垂体:4.47 甲状腺:4.16 副腎:4.32 膵臓:5.01 乳腺:4.53 唾液腺:4.46
CAGE 子宮:0.76 胎盤:0.08 前立腺:0.27 卵巣:0.37 精巣:1.09 心臓:0.04 骨格筋:0.88 食道:0.46 胃:- 腸:0.07 結腸:0.04     肝臓:0    肺:0.10 膀胱:0.18 腎臓:0.15 下垂体:0.71 甲状腺:0.17 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.00 精巣:0.54 心臓:0.00 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.05 副腎:0.22 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001794
Gene ID 1002
Unigene ID Hs.473231
Probe set ID 206866_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000179242
GTEx ID ENSG00000179242

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_009867
ラット[1]  NM_009867

染色体

20q13.33  [59,827,559  -  60,512,307]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

798233
2059658
7806582
7982033
8889548
9219219
10191097
10516427
10662782
10760957
10799302
11780052
12477932
14702039
15143071
15489334
15548679
16786001
17903297
18029348
19724895
19851296
20198315
20228063
20379614
20467438
20834067
20932310
21658281
21665361
22219182
22820501
23251661
23279374
23793025
23934736
24144296
24429027

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0034332  adherens junction organization
GO:0007411  axon guidance
GO:0007155  cell adhesion
GO:0034329  cell junction assembly
GO:0045216  cell-cell junction organization
GO:0007157  heterophilic cell adhesion
GO:0007156  homophilic cell adhesion
GO:0045773  positive regulation of axon extension

Cellular Component

GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding