CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase 2

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同義遺伝子名

OS4, Protein OS-4, PSR2, NLI-interacting factor 2, Small CTD phosphatase 2, Nuclear LIM interactor-interacting factor 2, NIF2, CTDSP2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:109 小脳:63 脳幹:- 脳梁:116.60 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:112.30 網膜:- 目:199.80 動脈:149.90 静脈:133.30 リンパ節:131.40 末梢血:109.30 脾臓:151.30 胸腺:231.90 骨髄:236.20 脂肪:80.70 骨:25.60 皮膚:110.40
GeneChip 大脳:8.15 小脳:8.56 脳幹:8.03 脳梁:8.80 松果体:- 末梢神経:8.67 脊柱:8.55 網膜:- 目:- 動脈:9.06 静脈:8.66 リンパ節:8.88 末梢血:- 脾臓:9.10 胸腺:9.03 骨髄:8.28 脂肪:9.22 骨:- 皮膚:8.96
CAGE 大脳:4.32 小脳:- 脳幹:4.41 脳梁:4.80 松果体:3.54 末梢神経:- 脊柱:4.39 網膜:- 目:- 動脈:5.00 静脈:4.82 リンパ節:4.59 末梢血:- 脾臓:4.79 胸腺:5.13 骨髄:- 脂肪:5.00 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.66 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:5.80 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:5.31 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:200.50 胎盤:134.80 前立腺:67.60 卵巣:335.40 精巣:47.60 心臓:242.70 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:97.20 結腸:254.40     肝臓:31.70        肺:195.50    膀胱:- 腎臓:83.20 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:160 乳腺:306.70 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.99 胎盤:8.73 前立腺:8.87 卵巣:9.42 精巣:7.63 心臓:8.62 骨格筋:8.73 食道:8.64 胃:9.01 腸:8.91 結腸:9.22 肝臓:8.81 肺:9.22 膀胱:- 腎臓:9 下垂体:8.28 甲状腺:9.04 副腎:9.06 膵臓:8.58 乳腺:9.37 唾液腺:9.56
CAGE 子宮:5.06 胎盤:4.85 前立腺:4.94 卵巣:4.94 精巣:4.39 心臓:4.73 骨格筋:4.47 食道:4.82 胃:- 腸:4.73 結腸:5.08     肝臓:4.48    肺:5.11 膀胱:5.00 腎臓:4.37 下垂体:4.10 甲状腺:4.79 副腎:- 膵臓:4.94 乳腺:4.82 唾液腺:5.07
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.53 卵巣:5.41 精巣:4.42 心臓:4.54 骨格筋:5.12 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:5.40     肝臓:4.37        肺:5.70    膀胱:- 腎臓:4.81 下垂体:- 甲状腺:5.10 副腎:5.02 膵臓:- 乳腺:5.19 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_005730
Gene ID 10106
Unigene ID Hs.524530
Probe set ID 203445_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000175215
GTEx ID ENSG00000175215

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]  NM_001113470, NM_146012
ラット[6]  NM_001113470, NM_146012

染色体

12q14.1  [58,213,710  -  58,240,522]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR011948  Dullard-like phosphatase domain
IPR004274  NLI interacting factor

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8090779
8673473
9315096
12477932
12721286
15146197
15489334
16344560
16724108
16751776
17085434
17207965
19004823
23000965

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006987  activation of signaling protein activity involved in unfolded protein response
GO:0044267  cellular protein metabolic process
GO:0030968  endoplasmic reticulum unfolded protein response
GO:0006470  protein amino acid dephosphorylation

Cellular Component

GO:0005654  nucleoplasm

Molecular Function

GO:0008420  CTD phosphatase activity
GO:0046872  metal ion binding