sorbin and SH3 domain containing 3

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同義遺伝子名

SH3D4, sorbin and SH3 domain containing 3, SORBS3, SH3-containing adapter molecule 1, SCAM1, vinexin, Sorbin and SH3 domain-containing protein 3, Vinexin, SCAM-1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:30.80 小脳:50.40 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:- 末梢神経:337.40 脊柱:112.30 網膜:- 目:152.80 動脈:60 静脈:- リンパ節:30.30 末梢血:72.90 脾臓:170.20 胸腺:- 骨髄:39.40 脂肪:40.30 骨:51.20 皮膚:24
GeneChip 大脳:5.40 小脳:5.52 脳幹:5.68 脳梁:5.51 松果体:- 末梢神経:5.51 脊柱:5.30 網膜:- 目:- 動脈:6.04 静脈:5.80 リンパ節:5.12 末梢血:- 脾臓:4.92 胸腺:4.63 骨髄:5.31 脂肪:6.03 骨:- 皮膚:5.87
CAGE 大脳:4.03 小脳:- 脳幹:4.13 脳梁:4.22 松果体:3.85 末梢神経:- 脊柱:4.47 網膜:- 目:- 動脈:5.29 静脈:4.61 リンパ節:4.11 末梢血:- 脾臓:4.00 胸腺:2.25 骨髄:- 脂肪:4.96 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.19 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.40 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.53 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:80.10 前立腺:157.70 卵巣:335.40 精巣:64.90 心臓:51.10 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:25.40     肝臓:10.60        肺:68.40    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:44.50 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.68 胎盤:5.18 前立腺:5.51 卵巣:5.51 精巣:6.65 心臓:5.62 骨格筋:5.28 食道:5.31 胃:5.13 腸:5.40 結腸:5.51 肝臓:5.48 肺:5.67 膀胱:- 腎臓:5.47 下垂体:5.73 甲状腺:5.25 副腎:5.23 膵臓:5.39 乳腺:5.38 唾液腺:5.19
CAGE 子宮:4.92 胎盤:4.26 前立腺:4.72 卵巣:4.87 精巣:4.90 心臓:4.61 骨格筋:4.32 食道:4.36 胃:- 腸:4.56 結腸:4.53     肝臓:4.59    肺:4.77 膀胱:4.71 腎臓:4.32 下垂体:3.98 甲状腺:4.32 副腎:- 膵臓:3.77 乳腺:5.08 唾液腺:4.30
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.55 卵巣:2.51 精巣:4.45 心臓:2.01 骨格筋:3.23 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.31     肝臓:1.11        肺:2.77    膀胱:- 腎臓:1.74 下垂体:- 甲状腺:3.03 副腎:3.42 膵臓:- 乳腺:3.25 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_005775
Gene ID 10174
Unigene ID Hs.528572
Probe set ID 207788_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000120896
GTEx ID ENSG00000120896

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_011366
ラット[1]  NM_001005762

染色体

8p21.3  [22,402,499  -  22,433,301]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR013315  Spectrin alpha chain, SH3 domain
IPR020473  Src homology-3, region

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9885244
10585480
11481476
12477932
12510380
12657639
12660241
14627618
15174051
15184391
15242778
15302935
15489334
15734736
16189514
16302969
16374509
16831423
16923119
16964243
17081983
17486060
18662323
19294487
19807924
20205591
20361963
22939629
23824909

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007155  cell adhesion
GO:0031589  cell-substrate adhesion
GO:0006936  muscle contraction
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0051495  positive regulation of cytoskeleton organization
GO:0043410  positive regulation of MAPKKK cascade
GO:0051496  positive regulation of stress fiber formation

Cellular Component

GO:0005856  cytoskeleton
GO:0005829  cytosol
GO:0005925  focal adhesion
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0005200  structural constituent of cytoskeleton
GO:0008134  transcription factor binding
GO:0017166  vinculin binding