splicing factor 3b, subunit 4, 49kDa

同義遺伝子名

subunit 4, SF3B4, splicing factor 3b, subunit 4, 49kDa, Pre-mRNA-splicing factor SF3b 49 kDa subunit, Spliceosome-associated protein 49, SF3b49, SAP49, MGC10828, Splicing factor 3B subunit 4, SAP 49, SF3b50

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:41.50

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:118.60

目:82.30

動脈:-

静脈:-

リンパ節:131.40

末梢血:127.50

脾臓:56.70

胸腺:51.50

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:-

皮膚:43.20

GeneChip

大脳:6.74

小脳:6.63

脳幹:6.46

脳梁:7

松果体:-

末梢神経:7.08

脊柱:7.03

網膜:-

目:-

動脈:7.66

静脈:7.28

リンパ節:7.58

末梢血:-

脾臓:7.39

胸腺:7.18

骨髄:7.51

脂肪:7.38

骨:-

皮膚:7.67

CAGE

大脳:3.55

小脳:-

脳幹:3.61

脳梁:4.16

松果体:3.25

末梢神経:-

脊柱:3.05

網膜:-

目:-

動脈:4.12

静脈:3.95

リンパ節:4.13

末梢血:-

脾臓:4.21

胸腺:4.66

骨髄:-

脂肪:4.11

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.04

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.60

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.75

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:65.60

前立腺:33.80

卵巣:37.30

精巣:30.30

心臓:12.80

骨格筋:20.10

食道:-

胃:85

腸:-

結腸:67.80

肝臓:10.60

肺:44

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:35.60

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.71

胎盤:7.75

前立腺:7.53

卵巣:7.43

精巣:8.67

心臓:6.87

骨格筋:6.18

食道:7.82

胃:7.45

腸:7.26

結腸:7.86

肝臓:7.16

肺:7.17

膀胱:-

腎臓:7.51

下垂体:7.51

甲状腺:7.98

副腎:8.03

膵臓:6.56

乳腺:8.07

唾液腺:7.58

CAGE

子宮:4.35

胎盤:4.39

前立腺:4.17

卵巣:4.60

精巣:4.77

心臓:3.42

骨格筋:3.03

食道:3.95

胃:-

腸:3.88

結腸:3.71

肝臓:3.91

肺:3.73

膀胱:4.04

腎臓:4.13

下垂体:3.69

甲状腺:4.15

副腎:-

膵臓:3.77

乳腺:3.49

唾液腺:4.19

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.19

卵巣:4.84

精巣:4.95

心臓:2.79

骨格筋:3.12

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.39

肝臓:2.98

肺:3.80

膀胱:-

腎臓:3.85

下垂体:-

甲状腺:4.08

副腎:4.26

膵臓:-

乳腺:3.66

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005850
Gene ID	10262
Unigene ID	Hs.516160
Probe set ID	209044_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000143368
GTEx ID	ENSG00000143368

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_153053
ラット[1]	NM_001011951

染色体

1q21.2 [149,895,209 - 149,900,236]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0006397	mRNA processing
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing
GO:0000375	RNA splicing, via transesterification reactions

Cellular Component

GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005681	spliceosomal complex
GO:0005689	U12-type spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

splicing factor 3b, subunit 4, 49kDa

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function