iroquois homeobox 5

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

iroquois homeobox protein 5, IRX5, IRX-2A, Iroquois homeobox protein 5, IRXB2, IRX-2a, IRX2A, Homeodomain protein IRXB2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:1.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:4.13 小脳:4.16 脳幹:4.32 脳梁:4 松果体:- 末梢神経:3.91 脊柱:4.50 網膜:- 目:- 動脈:4.23 静脈:4.04 リンパ節:4.03 末梢血:- 脾臓:3.82 胸腺:3.80 骨髄:4.11 脂肪:4.55 骨:- 皮膚:5.29
CAGE 大脳:0.60 小脳:- 脳幹:1.17 脳梁:0.79 松果体:0.43 末梢神経:- 脊柱:1.68 網膜:- 目:- 動脈:1.57 静脈:0.34 リンパ節:0.60 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0.37 骨髄:- 脂肪:1.41 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.01 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.59 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:29.30    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.92 胎盤:3.98 前立腺:4.94 卵巣:3.92 精巣:4.23 心臓:4.58 骨格筋:4.73 食道:5.16 胃:4.19 腸:4.38 結腸:3.97 肝臓:4.01 肺:4.40 膀胱:- 腎臓:5.18 下垂体:4.13 甲状腺:3.78 副腎:4.15 膵臓:4.32 乳腺:6.85 唾液腺:5.85
CAGE 子宮:1.01 胎盤:0 前立腺:1.66 卵巣:0.14 精巣:0.46 心臓:1.95 骨格筋:1.53 食道:2.12 胃:- 腸:0.07 結腸:0     肝臓:0.26    肺:2.48 膀胱:0.69 腎臓:1.66 下垂体:0.42 甲状腺:0.28 副腎:- 膵臓:0 乳腺:2.91 唾液腺:2.69
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.00 精巣:0.62 心臓:1.81 骨格筋:0.57 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.77 下垂体:- 甲状腺:0.09 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:1.89 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_005853
Gene ID 10265
Unigene ID Hs.435730
Probe set ID 210239_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000176842
GTEx ID ENSG00000176842

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_018826
ラット[1]  NM_001030044

染色体

16q12.2  [54,964,699  -  54,968,397]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10370142
11435706
12477932
16527195
17396150
18519790
21546767
22581230

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0048701  embryonic cranial skeleton morphogenesis
GO:0008406  gonad development
GO:0042551  neuron maturation
GO:0002027  regulation of heart rate
GO:0050896  response to stimulus
GO:0060040  retinal bipolar neuron differentiation
GO:0006351  transcription, DNA-dependent
GO:0007601  visual perception

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity
GO:0005499  vitamin D binding