splicing factor 3a, subunit 1, 120kDa

同義遺伝子名

PRPF21, PRP21, Spliceosome-associated protein 114, SF3A1, Prp21, SF3a120, splicing factor 3a, subunit 1, 120kDa, Splicing factor 3 subunit 1, SAP 114, SF3A120, SAP114

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:220.40

小脳:289.70

脳幹:-

脳梁:145.80

松果体:148.30

末梢神経:30.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:129.30

動脈:119.90

静脈:-

リンパ節:161.80

末梢血:145.70

脾臓:208

胸腺:889

骨髄:118.10

脂肪:40.30

骨:243.10

皮膚:105.60

GeneChip

大脳:7.37

小脳:7.88

脳幹:7.19

脳梁:7.53

松果体:-

末梢神経:7.72

脊柱:7.39

網膜:-

目:-

動脈:7.67

静脈:7.85

リンパ節:7.98

末梢血:-

脾臓:7.92

胸腺:7.99

骨髄:8.10

脂肪:7.86

骨:-

皮膚:8.09

CAGE

大脳:4.99

小脳:-

脳幹:4.67

脳梁:4.82

松果体:5.33

末梢神経:-

脊柱:4.79

網膜:-

目:-

動脈:4.91

静脈:5.32

リンパ節:5.25

末梢血:-

脾臓:5.04

胸腺:5.32

骨髄:-

脂肪:4.98

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.39

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:200.50

胎盤:80.10

前立腺:101.40

卵巣:-

精巣:250.90

心臓:51.10

骨格筋:80.40

食道:-

胃:21.20

腸:194.40

結腸:33.90

肝臓:168.90

肺:78.20

膀胱:628.10

腎臓:104

下垂体:232

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:17.80

乳腺:92.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.79

胎盤:7.44

前立腺:7.86

卵巣:8.08

精巣:7.94

心臓:7.37

骨格筋:7.80

食道:7.79

胃:7.62

腸:7.79

結腸:7.84

肝臓:7.28

肺:7.83

膀胱:-

腎臓:7.61

下垂体:7.64

甲状腺:8.05

副腎:7.43

膵臓:7.71

乳腺:8.21

唾液腺:7.70

CAGE

子宮:5.03

胎盤:4.76

前立腺:4.94

卵巣:5.17

精巣:5.82

心臓:4.92

骨格筋:4.97

食道:4.79

胃:-

腸:4.70

結腸:4.94

肝臓:4.79

肺:4.96

膀胱:4.92

腎臓:4.66

下垂体:4.95

甲状腺:5.01

副腎:-

膵臓:4.77

乳腺:5.14

唾液腺:5.03

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.03

卵巣:0.04

精巣:0.91

心臓:0.00

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.95

肝臓:0.80

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.33

副腎:1.27

膵臓:-

乳腺:0.69

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001005409
Gene ID	10291
Unigene ID	Hs.406277
Probe set ID	201356_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000099995
GTEx ID	ENSG00000099995

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_026175
ラット[1]	NM_001107235

染色体

22q12.2 [30,727,979 - 30,752,936]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000626	Ubiquitin
IPR019955	Ubiquitin supergroup

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0006397	mRNA processing
GO:0000389	nuclear mRNA 3'-splice site recognition
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005681	spliceosomal complex
GO:0005684	U2-type spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

splicing factor 3a, subunit 1, 120kDa

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function