nucleotide-binding oligomerization domain containing 1

同義遺伝子名

Nod1, caspase recruitment domain family, member 4, Caspase recruitment domain-containing protein 4, CARD4, Protein Nod1, NOD1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:7.10

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:224.60

網膜:-

目:5.90

動脈:-

静脈:66.60

リンパ節:10.10

末梢血:36.40

脾臓:56.70

胸腺:12.90

骨髄:19.70

脂肪:40.30

骨:25.60

皮膚:33.60

GeneChip

大脳:6.79

小脳:6.77

脳幹:6.82

脳梁:6.79

松果体:-

末梢神経:7.13

脊柱:6.68

網膜:-

目:-

動脈:7.34

静脈:7.30

リンパ節:7.34

末梢血:-

脾臓:7.64

胸腺:6.97

骨髄:7.47

脂肪:7.41

骨:-

皮膚:7.45

CAGE

大脳:1.19

小脳:-

脳幹:1.49

脳梁:1.71

松果体:1.38

末梢神経:-

脊柱:1.89

網膜:-

目:-

動脈:2.61

静脈:2.40

リンパ節:2.30

末梢血:-

脾臓:2.62

胸腺:1.73

骨髄:-

脂肪:2.80

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.85

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.49

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.99

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:63.80

胎盤:14.60

前立腺:-

卵巣:-

精巣:13

心臓:-

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:93.30

肝臓:31.70

肺:39.10

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.04

胎盤:7.21

前立腺:6.65

卵巣:7.28

精巣:6.59

心臓:7.49

骨格筋:6.98

食道:7.15

胃:7.24

腸:7.11

結腸:7.33

肝臓:6.94

肺:7.50

膀胱:-

腎臓:6.89

下垂体:6.87

甲状腺:6.90

副腎:7.01

膵臓:6.42

乳腺:7.27

唾液腺:7.34

CAGE

子宮:2.34

胎盤:2.10

前立腺:1.96

卵巣:2.71

精巣:1.49

心臓:2.67

骨格筋:1.83

食道:2.05

胃:-

腸:1.66

結腸:2.33

肝臓:1.29

肺:2.94

膀胱:2.22

腎臓:1.53

下垂体:1.68

甲状腺:3.31

副腎:-

膵臓:1.59

乳腺:3.06

唾液腺:2.31

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.12

卵巣:2.71

精巣:1.48

心臓:1.13

骨格筋:0.34

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.16

肝臓:0.56

肺:2.91

膀胱:-

腎臓:1.47

下垂体:-

甲状腺:2.66

副腎:2.50

膵臓:-

乳腺:1.92

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_006092
Gene ID	10392
Unigene ID	Hs.405153
Probe set ID	221073_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000106100
GTEx ID	ENSG00000106100

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_001171007, NM_172729
ラット[1]	NM_001109236, NM_172729

染色体

7p14.3 [30,464,143 - 30,518,400]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001315	Caspase Recruitment
IPR011029	DEATH-like

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006919	activation of caspase activity
GO:0000187	activation of MAPK activity
GO:0006915	apoptosis
GO:0006952	defense response
GO:0042742	defense response to bacterium
GO:0050830	defense response to Gram-positive bacterium
GO:0016045	detection of bacterium
GO:0009595	detection of biotic stimulus
GO:0006917	induction of apoptosis
GO:0006954	inflammatory response
GO:0045087	innate immune response
GO:0042228	interleukin-8 biosynthetic process
GO:0007254	JNK cascade
GO:0002755	MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway
GO:0002756	MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway
GO:0070423	nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway
GO:0002606	positive regulation of dendritic cell antigen processing and presentation
GO:0070374	positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
GO:0043123	positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade
GO:0032755	positive regulation of interleukin-6 production
GO:0046330	positive regulation of JNK cascade
GO:0051092	positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
GO:0032760	positive regulation of tumor necrosis factor production
GO:0051259	protein oligomerization
GO:0007165	signal transduction
GO:0051403	stress-activated MAPK cascade
GO:0034166	toll-like receptor 10 signaling pathway
GO:0034134	toll-like receptor 2 signaling pathway
GO:0034138	toll-like receptor 3 signaling pathway
GO:0034142	toll-like receptor 4 signaling pathway
GO:0034146	toll-like receptor 5 signaling pathway
GO:0034162	toll-like receptor 9 signaling pathway
GO:0002224	toll-like receptor signaling pathway

Cellular Component

GO:0016324	apical plasma membrane
GO:0016323	basolateral plasma membrane
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0050700	CARD domain binding
GO:0008656	caspase activator activity
GO:0042802	identical protein binding
GO:0042834	peptidoglycan binding
GO:0005515	protein binding
GO:0042803	protein homodimerization activity

nucleotide-binding oligomerization domain containing 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function